agp2assembly安装及使用

agp2assembly是juicebox_scripts之一。

功能：将agp文件转换为assembly文件。

官网：https://github.com/phasegenomics/juicebox_scripts

一、安装

cd ~/biosoft
git clone https://github.com/phasegenomics/juicebox_scripts.git
cd juicebox_scripts
python setup.py install

二、使用

usage:  agp2assembly.py <input_agp_file> <output_assembly_file>

三、结果

获得的*.assembly是所需的结果文件。

四、补充说明

另外还有很多脚本日后使用再补充。