使用find命令查询输出目录下特定文件名

由于上传ncbi填写文件名时，二代测序的paired reads文件需要分开file1、file2填写，而单个样本由*_1.fq.gz以及*_2.fq.gz组成因此需要分开输出对应文件名以便复制拷贝到表格中填写。

 

下图所示如样本AQ2由AQ2_1.fq.gz以及AQ2_2.fq.gz组成

使用find命令查询输出*_1.fq.gz

find *_1.fq.gz

使用find命令查询输出*_2.fq.gz

find *_2.fq.gz

如此一来便获取到两类不同类型的文件名，拷贝粘贴填入biosample表中，搞定。

样本文件名数量一多处理起来很麻烦，尤其是填写这种数据表格，通过shell命令确实很快很方便。