小鲨鱼2018

2023年2月25日

摘要： 001、q，表示退出（匹配地址后退出sed脚本） [root@PC1 test]# ls a.txt [root@PC1 test]# cat a.txt ## 测试数据 22 jj yy ss ff xx zz vv bb dd 00 ss 99 cc mm bb tt yy [root@PC1 阅读全文

posted @ 2023-02-25 17:14 小鲨鱼2018 阅读(233) 评论(0) 推荐(0) 编辑

linux 中awk命令制定输入行分隔符、列分割符、输出行分隔符、输出列分隔符的几种方法

摘要： 001、指定列的输入分隔符 [root@PC1 test]# ls a.txt [root@PC1 test]# cat a.txt aa:bb:cc 11:22:33 55:88:33 [root@PC1 test]# awk -F ":" '{print $2}' a.txt ## 使用-F 选阅读全文

posted @ 2023-02-25 17:08 小鲨鱼2018 阅读(2194) 评论(0) 推荐(0) 编辑

linux 命令行中几个高效快捷键

摘要： 001、 ctrl + a：将光标移动到命令行的开头，相当于键盘中的home键 002、 ctrl + e：将光标移动到命令行的结尾，相当于键盘中的end键 003、ctrl + u：剪切光标所在位置之前的内容 004、ctrl + k：剪切光标所在位置之后的内容 005、ctrl + y：阅读全文

posted @ 2023-02-25 09:48 小鲨鱼2018 阅读(65) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2023年2月24日

linux shell编程中的数组

摘要： 001、普通数组普通数组的定义： ay=(100 200 300 "aa" "bb") ## 直接定义 [root@PC1 test]# ay2[0]=800 ## 单独定义每一个元素 [root@PC1 test]# ay2[1]="aaaa" [root@PC1 test]# ay2[2]=5 阅读全文

posted @ 2023-02-24 23:48 小鲨鱼2018 阅读(50) 评论(0) 推荐(0) 编辑

linux shell编程中 case语句

摘要： 001、 [root@PC1 test]# ls test.sh [root@PC1 test]# cat test.sh ## 测试脚本 #!/bin/bash read -p "please input an character:" key ## 给变量key赋值 case $key in ## 阅读全文

posted @ 2023-02-24 22:52 小鲨鱼2018 阅读(19) 评论(0) 推荐(0) 编辑

linux 中利用 awk 数组依据指定列的字符统计累计总长度

摘要： 001、 [root@PC1 test]# ls a.txt [root@PC1 test]# cat a.txt ## 测试数据 a b c 3 d b e 7 a d e 8 z b c 4 a d e 1 [root@PC1 test]# awk '{array[$2] += $4} END 阅读全文

posted @ 2023-02-24 12:27 小鲨鱼2018 阅读(29) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2023年2月22日

linux 中grep命令如何匹配制表符

摘要： 001、 [root@PC1 test]# ls a.txt [root@PC1 test]# cat a.txt ## 测试数据 aa bb kk aa qq kk 11 kk dd kk mm xx [root@PC1 test]# cat -A a.txt ## 可以看到有tab制表符 aa^ 阅读全文

posted @ 2023-02-22 22:40 小鲨鱼2018 阅读(489) 评论(0) 推荐(0) 编辑

linux 中如何从文本中区分空格和tab键

摘要： 001、 [root@PC1 test]# ls a.txt [root@PC1 test]# cat a.txt ## 测试数据 aa bb cc dd 11 22 33 [root@PC1 test]# cat -A a.txt ## cat -A , tab键显示为^I aa bb^Icc^I 阅读全文

posted @ 2023-02-22 22:33 小鲨鱼2018 阅读(248) 评论(0) 推荐(0) 编辑

linux 中 awk命令实现将fasta文件中每个scaffold中的所有碱基转换为一行

摘要： 001、 [b20223040323@admin1 test]$ ls test.fa [b20223040323@admin1 test]$ cat test.fa ## 测试数据 >chr1 aabbccdd eeff >chr2 xxyyzzqq gg >chr3 ddjjiill ssff 阅读全文

posted @ 2023-02-22 08:49 小鲨鱼2018 阅读(46) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2023年2月17日

linux 中正则表达式匹配任意标点符号[[:punct:]]

摘要： 001、 root@ubuntu01:/home/test# ls a.txt root@ubuntu01:/home/test# cat a.txt ## 测试数据 2,7 3.23 72 3!8\34 34+3 444 root@ubuntu01:/home/test# awk '{print 阅读全文

posted @ 2023-02-17 23:16 小鲨鱼2018 阅读(300) 评论(0) 推荐(0) 编辑

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