小鲨鱼2018

2023年8月16日

摘要： 001、。 reference 祝光涛,黄三文.360度群体遗传变异扫描——大豆泛基因组研究[J].[2023-08-16].DOI:10.11983/CBB20096. 阅读全文

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摘要： 001、注： 01、Pacific Bio-sciences (PacBio)和Oxford Nanopore)：长片段单分子测序技术 02、BioNano genome mapping：辅助组装技术 03、High-throughput chromosome conformat 阅读全文

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2023年8月15日

动物育种技术的发展应用

摘要： 001、。阅读全文

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物种的遗传变异

摘要： 001、。阅读全文

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2023年8月14日

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摘要： 001、阅读全文

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线性泛基因组和图形泛基因组

摘要： 001、线性泛基因组仅仅包含序列信息，源于不同个体的变异信息被丢失。迭代组装、map-to-pan、个体de novo组装的泛基因组均是线性泛基因组。 002、图形泛基因组图结构泛基因组是一个二维序列图谱，它以参考基因组为框架，以单个碱基作为图的节点，碱基间的前后关系作为图的边，存在序列差异的阅读全文

posted @ 2023-08-14 22:23 小鲨鱼2018 阅读(153) 评论(0) 推荐(0) 编辑

开放泛基因组和闭合泛基因组

摘要：判定基因组为开放泛基因组和闭合泛基因组的依据：根据泛基因组中核心基因组的比例，将泛基因组分为开放型和闭合型两种。基于泛基因组大小随测序样本数目的变化趋势，泛基因组可分为闭合型和开放型两类。开放型泛基因组和闭合型泛基因组的根本区别在于增加样本数目后，泛基因组的大小是否会持续的增加。 001、阅读全文

posted @ 2023-08-14 20:56 小鲨鱼2018 阅读(135) 评论(0) 推荐(0) 编辑

泛基因组的概念

摘要： 001、基本概念 Tettelin 等在2005 首次在细菌的研究中提出泛基因组(pan-genome)的概念，指整个物种基因组序列的非冗余集合，其中包括存在于该物种几乎所有个体中的核心基因组(core genome)和仅在部分个体中存在的可变基因组(accessory/variable/dis 阅读全文

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泛基因组中核心序列和可变序列

摘要： 001、基本分类 01、为什么核心基因不是100%？核心基因从概念上讲是所有个体中都存在的基因，但是实际的测序过程中难以保证所有个体的每个DNA片段都有很好的测序质量，为了避免这种少部分个体部分片段未测出，遗漏核心基因的统计和分类，使用一个比例范围更可取。 02、为什么要有cloud 这个分类？阅读全文

posted @ 2023-08-14 17:04 小鲨鱼2018 阅读(97) 评论(0) 推荐(0) 编辑

原核生物基因重组转化、转导和接合的概念及区别

摘要： 001、 https://www.bilibili.com/video/BV1fF411879A/?vd_source=9f2c87b6a7fd328f19dccf7b7b1f8c1a 阅读全文

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