小鲨鱼2018

2021年12月18日

摘要： 1、测试数据 root@PC1:/home/test# ls test.py test.txt root@PC1:/home/test# cat test.txt ## 测试数据 w r s f z s d g z c w d z d g g z c e w root@PC1:/home/test# 阅读全文

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python中提取包含指定字符的行、提取以指定字符开头、指定字符结尾的行

摘要： 1、测试数据 root@PC1:/home/test# ls test.txt root@PC1:/home/test# cat test.txt ## 测试数据 w r s f a s d g z c w d a d g t z c e w 2、提取包含w的行 root@PC1:/home/tes 阅读全文

posted @ 2021-12-18 21:17 小鲨鱼2018 阅读(5806) 评论(0) 推荐(1) 编辑

2021年12月17日

plink 阈性状（质量性状）GWAS分析

摘要： plink进行阈性状（质量性状）关联分析有两种方法 --assoc 和 --logistic，这两种方法又分别有分是否校正： --assoc --adjust 和 --logistic --adjust --logistic方法有可以选择是否添加协变量： --logistic --covar 和阅读全文

posted @ 2021-12-17 23:47 小鲨鱼2018 阅读(2372) 评论(0) 推荐(0) 编辑

R语言中scale函数的用法

摘要： scale的作用 1、中心化：减去平均值 2、标准化：除以根方差 test <- c(2,3,4,6) ## 测试数据 a <- scale(test,center = F, scale = F) ## 既不中心化，也不标准化 a b <- scale(test, center = T, sc 阅读全文

posted @ 2021-12-17 19:01 小鲨鱼2018 阅读(1423) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2021年12月16日

R语言中读取列数不一致的数据，并依据列数筛选数据

摘要： 1、 dir() dat <- read.table('test.txt',fill = T) ## fill = T，读取列数不一致的行，用“”填充 dat result <- data.frame() ## 创建空数据框 result for (i in 1:nrow(dat)) { if (( 阅读全文

posted @ 2021-12-16 23:08 小鲨鱼2018 阅读(1439) 评论(0) 推荐(0) 编辑

linux shell删除文本每行末尾的单个或者多个空格或者制表符

摘要： 1、删除test.txt末尾的单个或者多个空格或者制表符 root@PC1:/home/test# ls test.txt root@PC1:/home/test# cat test.txt ## 测试数据 2 3 4 a 3 d d w e z v e z c g z v b root@PC1:/ 阅读全文

posted @ 2021-12-16 22:40 小鲨鱼2018 阅读(1396) 评论(0) 推荐(0) 编辑

linux shell中利用列数筛选数据

摘要： 1、测试数据，依据列数筛选数据 root@PC1:/home/test# ls test.txt root@PC1:/home/test# cat test.txt ## 测试数据 2 3 4 3 d a 3 d d w e f z v e z c g k e q z v b d root@PC1: 阅读全文

posted @ 2021-12-16 22:34 小鲨鱼2018 阅读(855) 评论(0) 推荐(0) 编辑

ubuntu中如何解压rar文件

摘要： 1、问题 ubuntu中解压rar文件，如下： root@PC1:/home/test2# ls test.rar root@PC1:/home/test2# unrar e test.rar -bash: /usr/bin/unrar: No such file or directory 2、解阅读全文

posted @ 2021-12-16 21:52 小鲨鱼2018 阅读(2469) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2021年12月15日

linux sort命令 -g选项

摘要： sort命令 -g选项忽略字母 1、测试数据 root@PC1:/home/test# ls a.txt root@PC1:/home/test# cat a.txt name gender score ddd 2 8 aa 1 87 ff 2 3 ss 1 23 root@PC1:/home/te 阅读全文

posted @ 2021-12-15 23:28 小鲨鱼2018 阅读(259) 评论(0) 推荐(0) 编辑

R实现将匹配字符行的最后一个字符替换为指定字符

摘要： 1、在a.txt中每行匹配的最后一个e替换为xxx（每行都有e的情况） dat <- read.table("a.txt", header = F) dat index <- data.frame() ## 创建数据框，储存匹配结果 for (i in 1:nrow(dat)) { count = 阅读全文

posted @ 2021-12-15 20:48 小鲨鱼2018 阅读(148) 评论(0) 推荐(0) 编辑

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