小鲨鱼2018

2022年5月15日

org.Mm.eg.db包的安装

摘要： 1、 BiocManager::install("org.Mm.eg.db") library(org.Mm.eg.db) 阅读全文

posted @ 2022-05-15 23:16 小鲨鱼2018 阅读(2280) 评论(0) 推荐(0) 编辑

摘要： R语言中assign用于给变量赋值。 001、 > assign("x", 100) ## 给x赋值 > x [1] 100 > assign("y", c("aaa", "bbb")) ## 给y赋值 > y [1] "aaa" "bbb" 002、用在循环中，批量生成变量名 > for (i 阅读全文

posted @ 2022-05-15 20:07 小鲨鱼2018 阅读(1016) 评论(0) 推荐(0) 编辑

R语言中mode和class的区别

摘要： mode：表示对象在内存中的存储类型。 class：表示的是变量的数据类型。 > a <- 1:10 > mode(a) ## 内存中存储为数值 [1] "numeric" > class(a) ## 变量类型为整数 [1] "integer" > b <- letters[1:10] > mode 阅读全文

posted @ 2022-05-15 19:55 小鲨鱼2018 阅读(600) 评论(0) 推荐(0) 编辑

R语言中attr()函数

摘要： attr()函数允许你创建任意属性并将其与对象关联。 1、 > a <- 1:5 > b <- letters[1:5] > c <- LETTERS[1:5] > dat <- data.frame(a, b, c) > dat ## 测试数据框 a b c 1 1 a A 2 2 b B 3 3 阅读全文

posted @ 2022-05-15 19:46 小鲨鱼2018 阅读(1985) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2022年5月14日

R语言中的ifelse条件表达语句

摘要：条件表达式： 1、 > a = 5 > ifelse(a %% 2 == 0, print("a is even"), print("a is odd")) ## 满足a %% 2 ==0，执行第一个语句，否则执行第二个语句 [1] "a is odd" [1] "a is odd" > a = 阅读全文

posted @ 2022-05-14 23:00 小鲨鱼2018 阅读(285) 评论(0) 推荐(0) 编辑

中位数绝对偏差Median Absolute Deviation（MAD）

摘要： 1、 MAD定义为数据点到中位数的绝对偏差的中位数：也就是说，先计算出数据与它们的中位数之间的残差（偏差），MAD就是这些偏差的绝对值的中位数。参考：https://blog.csdn.net/horses/article/details/78749485 阅读全文

posted @ 2022-05-14 21:57 小鲨鱼2018 阅读(2110) 评论(0) 推荐(1) 编辑

R语言中rnorm函数和runif函数

摘要： 1、 rnorm函数生成服从正态分布的随机数： > rnorm(10, 3, 1) ## 生成10个平均数为3，标准差为1的服从正态分布的随机数 [1] 3.445787 3.046501 3.085338 2.972996 3.852173 3.125537 3.335456 3.385395 1 阅读全文

posted @ 2022-05-14 21:00 小鲨鱼2018 阅读(1795) 评论(0) 推荐(0) 编辑

R语言中quantile函数求分位数

摘要： 1、分位数表示有百分之多少的数值小于该处的数值。 quantile函数默认返回五个数值：最小值、第一分位数值、第二分位（中位数）、第三分位数值、最大值。当数值个数为奇数时最为简单：举例1： > a <- c(1, 3, 4, 6, 7, 9, 15) > a ## 测试向量，长度为7，奇数阅读全文

posted @ 2022-05-14 19:23 小鲨鱼2018 阅读(5106) 评论(0) 推荐(0) 编辑

R语言绘制曼哈顿图给染色体分配颜色

摘要：方法1： 1、利用match函数实现 > dir() [1] "dat.map" > map <- read.table("dat.map") > map ## map文件 V1 V2 1 1 55910 2 1 85204 3 1 122948 4 2 167127 5 2 176079 6 2 阅读全文

posted @ 2022-05-14 00:02 小鲨鱼2018 阅读(225) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2022年5月13日

R语言中prod()、cumprod()函数

摘要： 1、 > a <- c(3, 2, 2, 4) ## 测试向量 > a [1] 3 2 2 4 > prod(a) ## 求所有向量的乘积 [1] 48 > cumprod(a) ## 向量元素累积求积 [1] 3 6 12 48 阅读全文

posted @ 2022-05-13 22:26 小鲨鱼2018 阅读(683) 评论(0) 推荐(0) 编辑

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