小鲨鱼2018

2022年7月11日

摘要： 001、 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test3# ls a.txt b.txt root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test3# cat a.txt e r s s f w z x v z v e root@DESKTOP-1N42TVH:/home/t 阅读全文

posted @ 2022-07-11 10:45 小鲨鱼2018 阅读(1062) 评论(0) 推荐(0) 编辑

linux 中如何在文件指定位置插入特定的列

摘要： 001、插入列 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test3# ls a.txt b.txt root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test3# cat a.txt e r s s f w z x v z v e root@DESKTOP-1N42TVH:/hom 阅读全文

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2022年7月10日

使用plink、gemma软件进行gwas分析增加协变量

摘要： 001、plink root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# ls cov.txt gwas_test.map gwas_test.ped root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# head cov.txt ## 协变量文件前两列FID、IID；第三阅读全文

posted @ 2022-07-10 23:25 小鲨鱼2018 阅读(1784) 评论(2) 推荐(1) 编辑

主板EATX、ATX、MATX、ITX

摘要： 001、 002、阅读全文

posted @ 2022-07-10 21:44 小鲨鱼2018 阅读(675) 评论(0) 推荐(0) 编辑

gemma、plink使用一般线性模型进行GWAS分析

摘要： 001、测试数据 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# ls ## 表型数据为ped文件的第6列 gwas_test.map gwas_test.ped 002、plink 一般线性模型GWAS （1）、 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# 阅读全文

posted @ 2022-07-10 12:44 小鲨鱼2018 阅读(457) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2022年7月9日

linux 中将科学计数法转换为数值表示（或将数值转换为科学技术法）

摘要： 001、科学计数法转换为普通数值表示 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# ls a.txt b.txt root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# cat a.txt 4.530733e-01 4.530733e-01 2.264793e-01 阅读全文

posted @ 2022-07-09 09:37 小鲨鱼2018 阅读(378) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2022年7月8日

R语言中精确匹配指定字符串

摘要： 001、 dat <- read.table("test.txt") dat idx <- vector() for (i in 1:nrow(dat)) { if ("AKCR02000001" %in% dat[i,]) { idx <- c(idx, i) } } idx dat[idx,] 阅读全文

posted @ 2022-07-08 23:15 小鲨鱼2018 阅读(748) 评论(0) 推荐(0) 编辑

linux 中awk命令实现字符串的精确匹配

摘要： 001、 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test3# ls test.txt root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test3# cat test.txt ## 测试数据 AKCR02000001 df AKCR02000001 df AKCR02000001 阅读全文

posted @ 2022-07-08 21:48 小鲨鱼2018 阅读(1336) 评论(0) 推荐(0) 编辑

linux 中awk命令实现字符串的精确替换

摘要： 001、 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test3# ls a.txt test.txt root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test3# cat a.txt ## 测试数据， 1、2列分别为替换字符和被替换字符 1 AKCR02000001 2 AKCR0 阅读全文

posted @ 2022-07-08 21:34 小鲨鱼2018 阅读(427) 评论(0) 推荐(0) 编辑

plink格式数据（ped文件第5列、第6列）

摘要： 001、ped文件第5列：表示性别信息（1表示male、2表示female、0或者其他字母表示未知） root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test3# ls outcome.map outcome.ped root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test3# cat 阅读全文

posted @ 2022-07-08 20:15 小鲨鱼2018 阅读(525) 评论(0) 推荐(0) 编辑

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