小鲨鱼2018

2022年8月3日

摘要： str_detect函数属于tidyverse包中函数，功能类似于grepl函数。 001、 str1 <- c("xx", "yy", "zz", "xx", "pp", "xx") str1 grepl("xx", str1) str_detect("xx", str1) 阅读全文

posted @ 2022-08-03 06:22 小鲨鱼2018 阅读(779) 评论(0) 推荐(0) 编辑

linux 中删除除第一次匹配特定字符串所在行之外的所有行

摘要： 001、shell实现 root@PC1:/home/test2# ls test.txt root@PC1:/home/test2# cat test.txt ## 测试数据，删除第一次匹配xpehh以外的所有匹配xpehh的行 01 ee ff 02 ee de 03 dd ee 04 jj 阅读全文

posted @ 2022-08-03 05:56 小鲨鱼2018 阅读(172) 评论(0) 推荐(0) 编辑

linux 中 awk print > 选项实现按照特定列拆分数据

摘要： 001、 root@PC1:/home/test2# ls test.map root@PC1:/home/test2# cat test.map ## 用一个map文件进行测试，按照染色体打乱顺序 6 snp16 0 312984 1 snp2 0 85204 5 snp15 0 204629 6 阅读全文

posted @ 2022-08-03 00:45 小鲨鱼2018 阅读(374) 评论(0) 推荐(0) 编辑

linux 中 gz文件压缩保留源文件、解压缩保留源文件

摘要： 001、压缩保留源文件 root@PC1:/home/test2# ls outcome.map root@PC1:/home/test2# gzip -c outcome.map > new.map.gz ## 压缩为gz文件，并保留源文件 root@PC1:/home/test2# ls new 阅读全文

posted @ 2022-08-03 00:20 小鲨鱼2018 阅读(653) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2022年8月2日

linux 系统中输出匹配特定字符至末尾的行

摘要： 001、 root@PC1:/home/test2# ls a.txt root@PC1:/home/test2# cat a.txt aa dd ss dd ff xv ef 33 cc xx ee ww df ff zc xx xx ff er ed ww xx xx ee er uy vv r 阅读全文

posted @ 2022-08-02 23:21 小鲨鱼2018 阅读(624) 评论(0) 推荐(0) 编辑

linux 系统中输出文本开头至匹配特定字符的行

摘要： 001、 root@PC1:/home/test2# ls a.txt root@PC1:/home/test2# cat a.txt aa dd ss dd ff xv ef 33 cc xx ee ww df ff zc xx xx ff er ed ww xx xx ee er uy vv r 阅读全文

posted @ 2022-08-02 23:12 小鲨鱼2018 阅读(577) 评论(0) 推荐(0) 编辑

ggplot2 绘图调整画布的大小

摘要： 001、 library(cowplot) library(ggplot2) a <- ggplot(mtcars, aes(x = mpg)) + geom_histogram(binwidth = 4) + theme(plot.margin=unit(c(1, 1, 1, 1),'cm')) 阅读全文

posted @ 2022-08-02 00:12 小鲨鱼2018 阅读(4286) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2022年8月1日

根据位点的物理位置、重组率计算遗传距离

摘要： 001、shell root@PC1:/home/test2/test# ls genetic_map.txt root@PC1:/home/test2/test# head genetic_map.txt | column -t position COMBINED_rate(cM/Mb) Gene 阅读全文

posted @ 2022-08-01 17:52 小鲨鱼2018 阅读(398) 评论(0) 推荐(0) 编辑

linux 中 tar.lzma 文件的解压、压缩

摘要： 001、解压 .tar.lzma文件 root@PC1:/home/test2/test# ls test_chr22.tar.lzma ## 增加 -k 参数保留源文件 unlzma -k test_chr22.tar.lzma root@PC1:/home/test2/test# unlzma 阅读全文

posted @ 2022-08-01 12:06 小鲨鱼2018 阅读(676) 评论(0) 推荐(0) 编辑

module: command not found

摘要： 001、 module: command not found 002、 root@PC1:/home/test# cat /proc/version Linux version 5.15.0-41-generic (buildd@lcy02-amd64-105) (gcc (Ubuntu 9.4.0 阅读全文

posted @ 2022-08-01 01:03 小鲨鱼2018 阅读(787) 评论(0) 推荐(0) 编辑

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