小鲨鱼2018

2024年3月27日

摘要： 001、测试数据 [root@pc1 test01]# ls a.txt idx.txt [root@pc1 test01]# cat a.txt ## 测试数据 01 02 03 04 05 06 1 07 08 09 10 11 12 2 13 14 15 16 17 18 3 19 20 21 阅读全文

posted @ 2024-03-27 18:23 小鲨鱼2018 阅读(13) 评论(0) 推荐(0) 编辑

linux 中 grep匹配区分空格和制表符

摘要： 001、 [root@pc1 test]# ls a.txt [root@pc1 test]# cat a.txt ## 测试数据 aa bb cc aa jj kk aa mm uy aa mm ww [root@pc1 test]# grep "aa\t" a.txt ##\t在这里不能被识别，阅读全文

posted @ 2024-03-27 10:57 小鲨鱼2018 阅读(92) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2024年3月26日

编程四大件是什么

摘要： 01、数据结构与算法 02、操作系统 03、计算机网络 04、计算机组成原理 05、设计模式？？ 06、数据库？？阅读全文

posted @ 2024-03-26 08:26 小鲨鱼2018 阅读(21) 评论(0) 推荐(0) 编辑

设计模式是什么。

摘要：设计模式总结了软件开发人员在长期实践中积累的经验，并把这些经验系统化、分类化，以便于在新的项目中复用这些解决方案。设计模式主要应用于面向对象编程语言中，它们描述了如何组织代码以解决重复出现的设计问题，从而提高软件的可重用性、可维护性、扩展性和灵活性。设计模式可以概括为一系列类或对象之间的相互作用，阅读全文

posted @ 2024-03-26 08:25 小鲨鱼2018 阅读(2) 评论(0) 推荐(0) 编辑

编程中的三种范式

摘要： 1、面向对象编程（继承、类、多态） 2、面向过程编程（与函数相关；全局变量） 3、面向函数编程（函数式编程）（与函数相关；局部变量）。阅读全文

posted @ 2024-03-26 08:25 小鲨鱼2018 阅读(4) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2024年3月25日

R语言中为什么后者比前者快这么多？？

摘要：前者：for (row in 1:nrow(gterms)) { gene_terms <- str_split(gterms[row,"GOs"], ",", simplify = FALSE)[[1]] gene_id <- gterms[row, "query"][[1]] tmp <- da 阅读全文

posted @ 2024-03-25 23:10 小鲨鱼2018 阅读(5) 评论(0) 推荐(0) 编辑

R语言中shapply、unlist函数的应用

摘要： R语言中sappy、unlist函数的应用 gene_to_go <- data.frame(gene = rep(gene_ids[eggnog_lines_with_go], times = sapply(eggnog_annoations_go, length)), term = unlist 阅读全文

posted @ 2024-03-25 23:07 小鲨鱼2018 阅读(12) 评论(0) 推荐(0) 编辑

函数‘select’标签‘"data.frame"’找不到继承方法

摘要： 001、R 语言中出现如下报错 > a <- 1:5 > b <- letters[1:5] > test <- data.frame(a, b) > library(dplyr) > select(test, a) Error in (function (classes, fdef, mtable 阅读全文

posted @ 2024-03-25 22:34 小鲨鱼2018 阅读(731) 评论(0) 推荐(0) 编辑

R 语言中双中括号 [[]]与数据类型列表的关系

摘要： R 语言中双中括号 [[]]与数据类型列表的关系。 for (row in 1:nrow(gterms)) { gene_terms <- str_split(gterms[row,"GOs"], ",", simplify = FALSE)[[1]] gene_id <- gterms[row, 阅读全文

posted @ 2024-03-25 22:27 小鲨鱼2018 阅读(40) 评论(0) 推荐(0) 编辑

R语言中管道符号 %>% 的应用及举例

摘要： R语言中管道符号 %>% 的应用及举例 gterms <- egg %>% dplyr::select(query, GOs) %>% na.omit() gene2go <- data.frame(term = character(), gene = character()) 阅读全文

posted @ 2024-03-25 22:26 小鲨鱼2018 阅读(20) 评论(0) 推荐(0) 编辑

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