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比对文件sam文件的解读 阅读全文
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001、 #提取比对到参考基因组上的数据 samtools view -b -F 4 lane.sam > lane.bam #提取没有比对到参考基因组上的数据 samtools view -b -f 4 lane.sam > lane.bam 提取双端序列都比对到参考序列（4+8）的结果： sam 阅读全文
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001、 [root@PC1 test2]# ls test.sh [root@PC1 test2]# cat test.sh ## 脚本 #!/bin/bash seq 10000000000000000000000000000000000000 &> /dev/null [root@PC1 te 阅读全文
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001、方法1 [root@PC1 test2]# ls a.txt [root@PC1 test2]# cat a.txt 01 02 03 04 05 06 07 08 09 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 阅读全文
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001、 [root@PC1 test2]# ls a.txt [root@PC1 test2]# cat a.txt ## 测试数据 01 02 03 04 05 06 07 08 09 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 2 阅读全文
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001、 [root@PC1 test3]# echo "Hello, my name is aming."|grep -P '(?<=Hello, ).*(?= aming.)' Hello, my name is aming. 002、 [root@PC1 test3]# ifconfig | 阅读全文
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001、原始数据 Longitude Latitude diqu subspe num -104 39 West_Europe Bos_taurus 10 -3 56 West_Europe Bos_taurus 30 -3 51 West_Europe Bos_taurus 20 2 -44 Ce 阅读全文
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01、 [liujiaxin01@PC1 test2]$ ascp -i ~/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh -l 100M -T -P33001 fasp-g1k@fasp.1000genomes.ebi.ac.uk:vol1/ftp/re 阅读全文
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ascp -QT -i ~/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh -l 1000M -k 1 -T anonftp@ftp.ncbi.nlm.nih.gov:/blast/db/nr.00.tar.gz ./ 002 ascp -QT -i ~/. 阅读全文
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001、 --split-files：所有情况 --split-3：双端 --split-files通用。 ref： 01：https://www.biostars.org/p/186741/ 阅读全文