小鲨鱼2018

2025年3月14日

摘要： 001、分离SNP和indel vcftools --vcf snp_indel.vcf --remove-indels --recode --recode-INFO-all --out SNPs_onlyref：01、https://zhuanlan.zhihu.com/p/580033911 阅读全文

posted @ 2025-03-14 14:49 小鲨鱼2018 阅读(34) 评论(0) 推荐(0)

vcftools计算基因组观测杂合度

摘要： 001、vcftools计算基因组观测杂合度阅读全文

posted @ 2025-03-14 11:53 小鲨鱼2018 阅读(25) 评论(0) 推荐(0)

vcftools根据个体id提取数据和删除数据

摘要： 001、vcftools根据个体id提取数据 [b20223040323@admin2 test5]$ ls ## 测试数据 id.list outcome.vcf [b20223040323@admin2 test5]$ cat id.list ## 提取的ID GMM5 GMM6 GMM7 GM 阅读全文

posted @ 2025-03-14 11:16 小鲨鱼2018 阅读(51) 评论(0) 推荐(0)

2025年3月13日

linux shell中如何实现矩阵文件按照某一列的指定顺序排序

摘要： 001、linux shell中如何实现矩阵文件按照某一列的指定顺序排序 [s20213040583@admin2 test]$ ls a.txt idx.txt [s20213040583@admin2 test]$ cat a.txt ## 测试数据 d 100 888 c 666 999 a 阅读全文

posted @ 2025-03-13 15:15 小鲨鱼2018 阅读(10) 评论(0) 推荐(0)

SNeP1.1 Segmentation fault (core dumped) 段错误

摘要： 001、问题 002、问题原因：ped文件用tab分割 [b20223040323@admin2 test5]$ ls outcome.map outcome.ped step1.slurm [b20223040323@admin2 test5]$ head outcome.ped | cut -f 阅读全文

posted @ 2025-03-13 11:55 小鲨鱼2018 阅读(16) 评论(0) 推荐(0)

Linux 中如何区分文本使用空格还是制表符分割

摘要： 001、Linux 中如何区分文本使用空格还是制表符分割 [root@PC1 test]# ls a.txt b.txt [root@PC1 test]# cat a.txt ## 测试数据空格分割 01 02 03 04 05 06 07 08 09 10 11 12 13 14 15 16 阅读全文

posted @ 2025-03-13 11:43 小鲨鱼2018 阅读(10) 评论(0) 推荐(0)

2025年3月12日

ai中打出弧形文字

摘要： 001、 https://baijiahao.baidu.com/s?id=1781105847310201159&wfr=spider&for=pc 阅读全文

posted @ 2025-03-12 16:50 小鲨鱼2018 阅读(8) 评论(0) 推荐(0)

2025年3月11日

linux 中 awk命令利用数组对指定列去重复

摘要： 001、实例如下： (base) [b20223040323@admin2 test]$ ls a.txt (base) [b20223040323@admin2 test]$ cat a.txt ## 测试数据，第一列又两类重复 aa 11 bb 89 aa 77 kk 66 aa 88 kk 阅读全文

posted @ 2025-03-11 16:13 小鲨鱼2018 阅读(30) 评论(0) 推荐(0)

ERROR: Paired-end reads were detected in single-end read library : SRR208975

摘要： 001、featureCount命令报错：ERROR: Paired-end reads were detected in single-end read library : SRR208975 featureCounts -a GCF_034140825.1_ASM3414082v1_genomi 阅读全文

posted @ 2025-03-11 11:52 小鲨鱼2018 阅读(109) 评论(0) 推荐(0)

linux 中awk命令删除指定字段中特定字符串前边所有内容

摘要： 001、删除第9个字段gene_id前边的所有内容 [b20223040323@admin2 test]$ ls a.txt [b20223040323@admin2 test]$ cat a.txt ## 测试数据 NC_089035.1 Gnomon transcript 7328 15219 阅读全文

posted @ 2025-03-11 11:26 小鲨鱼2018 阅读(33) 评论(0) 推荐(0)

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