小鲨鱼2018

2023年2月15日

摘要： grep中的-x选项表示当前行只存在匹配项时才输出。 001、 [b20223040323@admin1 test]$ ls a.txt [b20223040323@admin1 test]$ cat a.txt ## 测试数据 ID3-A CCNYL1-B COQ10B-A ID3 DLD-1 [ 阅读全文

posted @ 2023-02-15 23:16 小鲨鱼2018 阅读(378) 评论(0) 推荐(0) 编辑

linux 中查看/tmp目录的可用容量

摘要： 001、/tmp在根目录/下挂载，因此/tmp的可用容量实际就是根目录/的可用容量。 [root@PC1 liujiaxin02]# df -h Filesystem Size Used Avail Use% Mounted on /dev/mapper/centos-root 50G 5.6G 4 阅读全文

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2023年2月11日

在命令行终端中指定标准输出和标准错误输出

摘要： 001、单独指定标准输出和标准错误输出 [root@PC1 test]# ls a.txt [root@PC1 test]# cat a.txt ## 测试数据 3 7 3 6 3 7 6 0 3 0 [root@PC1 test]# awk '{print $1/$2}' a.txt 1> xx 阅读全文

posted @ 2023-02-11 23:42 小鲨鱼2018 阅读(189) 评论(0) 推荐(0) 编辑

1G=1024Mb 1Mb=1024kb 1kb=1000bp

摘要：一直纠结这种单位换算，是1024还是1000，原来是这样计算的。来源：https://www.jianshu.com/p/6da01c23d1c0 阅读全文

posted @ 2023-02-11 23:05 小鲨鱼2018 阅读(973) 评论(0) 推荐(0) 编辑

samtools 实现对bam文件统计测序深度和比对率

摘要： 001、利用samtools计算每一个位点的测序深度 [b20223040323@admin1 test]$ ls ## 测试bam文件 SRR21814498.sorted.markdup.bam SRR21814498.sorted.markdup.bam.bai [b20223040323@a 阅读全文

posted @ 2023-02-11 22:44 小鲨鱼2018 阅读(1866) 评论(0) 推荐(0) 编辑

linux 中判断一组数据是否是等量递增

摘要： 001、 [root@PC1 test]# ls a.txt [root@PC1 test]# cat a.txt ## 测试数据 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 [root@PC1 test]# awk '{if(NR == 1) {a = $0}; if(NR > 1 && $0 - 阅读全文

posted @ 2023-02-11 12:13 小鲨鱼2018 阅读(26) 评论(0) 推荐(0) 编辑

linux 中判断一组数据是否已经按照从小到大的顺序排列

摘要： 001、 [root@PC1 test2]# ls a.txt [root@PC1 test2]# cat a.txt ## 测试数据 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 [root@PC1 test2]# awk '{if(NR == 1) {a = $0}; if($0 < a) {pri 阅读全文

posted @ 2023-02-11 12:04 小鲨鱼2018 阅读(36) 评论(0) 推荐(0) 编辑

ABRT has detected 1 problem(s). For more info run: abrt-cli list 解决方法

摘要： 001、 i5 12代CPU安装虚拟机出现如下警告 002、关闭虚拟机 003、点击编辑虚拟机设置 004、点击处理器，然后取消虚拟化CPU性能计数器 005、开启虚拟机验证。阅读全文

posted @ 2023-02-11 00:28 小鲨鱼2018 阅读(845) 评论(0) 推荐(0) 编辑

默认声音设备无法打开：使用的设备标识号超出本地系统范围

摘要： 001、VMware 安装centos7 中出现如下警告 002、解决方法在虚拟机标签处右击弹出对话框，选择设置 003、点击声卡，然后勾选已连接即可阅读全文

posted @ 2023-02-11 00:07 小鲨鱼2018 阅读(1139) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2023年2月10日

bwa 软件输出结果的同时记录日志文件

摘要： 001、 bwa mem -M -R "@RG\tID:name\tPL:illumina\tSM:name" ref.fna name_1.fastq.gz name_2.fastq.gz -o name.sam &> mem.log 阅读全文

posted @ 2023-02-10 16:20 小鲨鱼2018 阅读(102) 评论(0) 推荐(0) 编辑

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