06 2024 档案
摘要：https://blog.csdn.net/crewkickse/article/details/131513734 4： 代表这个序列没有mapping到参考序列上 8： 代表这个序列的另一端序列没有比对到参考序列上，比如这条序列是R1,它对应的R2端序列没有比对到参考序列上 64 ： 代表这个序
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摘要：001、 #提取比对到参考基因组上的数据 samtools view -b -F 4 lane.sam > lane.bam #提取没有比对到参考基因组上的数据 samtools view -b -f 4 lane.sam > lane.bam 提取双端序列都比对到参考序列（4+8）的结果： sam
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摘要：001、 [root@PC1 test2]# ls test.sh [root@PC1 test2]# cat test.sh ## 脚本 #!/bin/bash seq 10000000000000000000000000000000000000 &> /dev/null [root@PC1 te
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摘要：001、方法1 [root@PC1 test2]# ls a.txt [root@PC1 test2]# cat a.txt 01 02 03 04 05 06 07 08 09 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29
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摘要：001、 [root@PC1 test2]# ls a.txt [root@PC1 test2]# cat a.txt ## 测试数据 01 02 03 04 05 06 07 08 09 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 2
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摘要：001、 [root@PC1 test3]# echo "Hello, my name is aming."|grep -P '(?<=Hello, ).*(?= aming.)' Hello, my name is aming. 002、 [root@PC1 test3]# ifconfig |
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摘要：001、原始数据 Longitude Latitude diqu subspe num -104 39 West_Europe Bos_taurus 10 -3 56 West_Europe Bos_taurus 30 -3 51 West_Europe Bos_taurus 20 2 -44 Ce
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摘要：01、 [liujiaxin01@PC1 test2]$ ascp -i ~/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh -l 100M -T -P33001 fasp-g1k@fasp.1000genomes.ebi.ac.uk:vol1/ftp/re
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摘要：ascp -QT -i ~/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh -l 1000M -k 1 -T anonftp@ftp.ncbi.nlm.nih.gov:/blast/db/nr.00.tar.gz ./ 002 ascp -QT -i ~/.
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摘要：001、 --split-files：所有情况 --split-3：双端 --split-files通用。 ref： 01：https://www.biostars.org/p/186741/
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摘要：001、 -c 选项表示中断后继续下载，即支持断点续传。 002、 -t选项表示失败后尝试的次数。
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摘要：001、使用srapath命令 [root@PC1 test2]# srapath SRR1482463 https://sra-pub-run-odp.s3.amazonaws.com/sra/SRR1482463/SRR1482463 [root@PC1 test2]# srapath SRR1
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摘要：001、 [root@pc1 test]# ls a.txt b.txt c.txt d.txt e.txt f.txt g.txt h.txt index.txt [root@pc1 test]# cat index.txt ## 查找的索引文件 a.txt b.txt x.txt y.txt c
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摘要：000、 上传前注册了ORCID账号 001、打开NCBI官网，然后点击submit 002、 点击SRA 003、 004、 005、 006、 007、 008、 009、 010、 011、 注：*organism列批量多个样品时，可加-1、-2……进行区分，否则上传时提示失败。 示例信息如下
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摘要：001、 获取当前的工作路径： set current_dir=%cd% echo %current_dir% 。 002、改变工作路径 cd C:\Users\ljx\Desktop\test 。
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摘要：date主要用于显示日期，若是不以加号作为开头，则表示要设定时间，而时间格式为 MMDDhhmm[[CC]YY][.ss]，其中 MM 为月份，DD 为日，hh 为小时，mm 为分钟，CC 为年份前两位数字，YY 为年份后两位数字，ss 为秒数。 001、最基本的用法 [root@PC1 test2
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摘要：001、 [root@PC1 test2]# ls a.txt [root@PC1 test2]# cat a.txt 01 aa 02 03 04 aa 05 06 07 bb 08 09 10 bb 11 12 13 aa 14 15 16 bb 17 18 19 cc 20 21 22 cc
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摘要：001、Linux中sed命令b选项屏蔽指定的处理区域 [root@pc1 test2]# ls a.txt [root@pc1 test2]# cat a.txt ## 测试数据 1 01 02 a 2 03 04 a 3 05 06 a 4 07 08 5 09 10 k 6 11 12 a 7
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摘要：001、 # 创建一个多边形 df <- data.frame( x = c(1, 2, 2, 1, 1.26), y = c(1, 1, 2, 1.6, 1.26) ) df # 绘制多边形 ggplot() + geom_polygon(data = df, aes(x = x, y = y),
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摘要：001、frame.plot = T参数绘图 设置是否显示图边框 par(mfrow = c(1,2)) plot(1:10, cex = 3, pch = 19, frame.plot = T, main = "111") ## 显示图边框 plot(1:10, cex = 3, pch = 19
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