摘要: 001、 [root@pc1 test1]# ls a.fa test.py [root@pc1 test1]# cat a.fa >chr1 tttcccggg >chr2 tttgggjjj cccjjjjjj >chr3 ccc >chr4 aaaaatt [root@pc1 test1]# 阅读全文
posted @ 2023-10-13 23:27 小鲨鱼2018 阅读(20) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 001、 a、 [root@pc1 test1]# ls a.fa test.py [root@pc1 test1]# cat a.fa ## 测试fasta >chr1 tttcccggg >chr2 tttggg ccc >chr3 cccttt >chr4 aaaaattt [root@pc1 阅读全文
posted @ 2023-10-13 23:00 小鲨鱼2018 阅读(52) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 001、 [root@pc1 test1]# ls a.fa chr.list test.py [root@pc1 test1]# cat a.fa ## 测试fasta文件 >chr1 tttcccggg >chr2 tttggg ccc >chr3 cccttt >chr4 aaaaattt [ 阅读全文
posted @ 2023-10-13 20:37 小鲨鱼2018 阅读(121) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 001、问题:conda安装samtools后调用出现如下报错: samtools: error while loading shared libraries: libcrypto.so.1.0.0: cannot open shared object file: No such file or d 阅读全文
posted @ 2023-10-13 18:05 小鲨鱼2018 阅读(265) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 001、问题 conda 安装samtools出现如下问题: (base) [root@pc1 home]# conda install samtools -c bioconda 002、解决方法 更新conda: (base) [root@pc1 home]# conda --version ## 阅读全文
posted @ 2023-10-13 17:54 小鲨鱼2018 阅读(806) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 001、 [root@pc1 test1]# ls a.fa chr.list [root@pc1 test1]# cat a.fa ## 测试fasta >chr1 tttcccggg >chr2 tttggg ccc >chr3 cccttt >chr4 aaaaattt [root@pc1 t 阅读全文
posted @ 2023-10-13 17:22 小鲨鱼2018 阅读(280) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 01、 [root@pc1 test1]# python3 Python 3.11.4 (main, Jul 5 2023, 14:15:25) [GCC 11.2.0] on linux Type "help", "copyright", "credits" or "license" for mo 阅读全文
posted @ 2023-10-13 16:09 小鲨鱼2018 阅读(13) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 001、 awk + 数组实现 [root@pc1 test2]# ls a.txt [root@pc1 test2]# cat a.txt ## 测试数据 a b b a b c f f b a [root@pc1 test2]# awk '{ay[$0]++; print ay[$0], $0} 阅读全文
posted @ 2023-10-13 14:42 小鲨鱼2018 阅读(29) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 001、 awk实现 [root@pc1 test1]# ls a.txt [root@pc1 test1]# cat a.txt ## 测试文件 >jcf7180003470556 2 7 >jcf7180003470556 3 8 >jcf7180003470552 4 9 6 >jcf7180 阅读全文
posted @ 2023-10-13 14:32 小鲨鱼2018 阅读(11) 评论(0) 推荐(0) 编辑