摘要: 001、问题 *** These critical programs are missing or too old: compiler 002、查看c编译器版本 [root@PC1 build]# gcc --version gcc (GCC) 4.8.5 20150623 (Red Hat 4.8 阅读全文
posted @ 2023-07-15 23:13 小鲨鱼2018 阅读(3744) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 001、问题 *** These critical programs are missing or too old: make compiler 002、查看当前的make版本 [root@PC1 build]# make --version 003、make官网:http://ftp.gnu.or 阅读全文
posted @ 2023-07-15 23:03 小鲨鱼2018 阅读(2256) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: glibc是GNU发布的libc库,即c运行库。glibc是linux系统中最底层的api,几乎其它任何运行库都会依赖于glibc。glibc除了封装linux操作系统所提供的系统服务外,它本身也提供了许多其它一些必要功能服务的实现。由于glibc囊括了几乎所有的 UNIX 通行的标准,可以想见其内 阅读全文
posted @ 2023-07-15 21:49 小鲨鱼2018 阅读(1975) 评论(0) 推荐(1) 编辑
摘要: 001、 [root@PC1 test01]# ls [root@PC1 test01]# seq 5 > a.txt; seq 3 > b.txt ## 生成测试数据 [root@PC1 test01]# ls a.txt b.txt [root@PC1 test01]# md5sum b.txt 阅读全文
posted @ 2023-07-15 21:01 小鲨鱼2018 阅读(198) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 001、 [root@PC1 test01]# ls ## 测试文件 a.txt.gz [root@PC1 test01]# gzip -dc a.txt.gz > a.txt ## 解压,同时保留源文件 [root@PC1 test01]# ls a.txt a.txt.gz [root@PC1 阅读全文
posted @ 2023-07-15 20:53 小鲨鱼2018 阅读(173) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 001、 002、 003、 004、 005、 006、 007、 链接:https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/db/FASTA/ 。 nt为核酸数据库,nr为蛋白质数据库 008、使用命令行下载 a、 [root@PC1 test02]# wget -c http 阅读全文
posted @ 2023-07-15 16:52 小鲨鱼2018 阅读(1302) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 001、对数据库构建索引 [root@PC1 001_protein_database]# ls protein.faa ## 构建索引 [root@PC1 001_protein_database]# makeblastdb -in protein.faa -dbtype prot -title 阅读全文
posted @ 2023-07-15 12:04 小鲨鱼2018 阅读(457) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: GCF: RefSeq GCA: GenBank 前者可能更可靠一些。 阅读全文
posted @ 2023-07-15 11:47 小鲨鱼2018 阅读(1087) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: uniprot数据库:https://www.uniprot.org/ 阅读全文
posted @ 2023-07-15 10:10 小鲨鱼2018 阅读(10) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 001、 if(!requireNamespace("BiocManager",quietly=TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("topGO", force = TRUE) library(topGO) 。 阅读全文
posted @ 2023-07-15 09:51 小鲨鱼2018 阅读(340) 评论(0) 推荐(0) 编辑