摘要:
001、 [root@pc1 test4]# ls test.fa [root@pc1 test4]# cat test.fa ## 测试fasta文件 >mmm 11111 >bbb 888888 7777 >kkk 6666666 99999 >qqq 0000 33333 [root@pc1 阅读全文
摘要:
001、 [root@pc1 test1]# ls a.txt [root@pc1 test1]# cat a.txt 3 5 3 aa 3 3 4 3 3 aa 8 8 8 [root@pc1 test1]# awk '{a=($0 ~ "aa"); print a}' a.txt ## 匹配成功 阅读全文
摘要:
001、提取单条contig [root@pc1 test4]# ls test.fa [root@pc1 test4]# cat test.fa ## 测试fasta文件 >contig_1 ATAGAGACGACC >contig_2 ATAGGACNNAGACACGTTAGAT >contig 阅读全文
摘要:
官网:https://gatk.broadinstitute.org/hc/en-us/articles/5358869876891-GenomicsDBImport 001、一般用法,变异检测库 gatk --java-options "-Xmx4g -Xms4g" GenomicsDBImpor 阅读全文