11 2022 档案
摘要：001、准备如下word界面 002、右击标题1 003、选择修改 004、点击格式 005、选择编号 006、点击定义编号格式 007、输入编号格式 008、选择样式 009、点击确认 010、两个都点击确认 011、点击标题1 012、选择图片位置 013、点击引用 014、选择插入题注 015
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摘要：001、问题 >>> import gffutils Traceback (most recent call last): File "<stdin>", line 1, in <module> ModuleNotFoundError: No module named 'gffutils' 002、
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摘要：001、 问题 >>> from Bio import SeqIO 002、解决方法 pip3 install biopython -i https://pypi.douban.com/simple 003、测试效果 from Bio import SeqIO
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摘要：001、 [root@pc1 test2]# ls a.txt test.py [root@pc1 test2]# cat a.txt ## 测试序列 AGCTTCCCC [root@pc1 test2]# cat test.py ## 测试程序 #!/usr/bin/python in_file
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摘要：001、 [root@pc1 test3]# ls a.txt [root@pc1 test3]# cat a.txt ## 测试数据 ad_33;hh_kk dd;ff;dd;77 uu_77_88_99 [root@pc1 test3]# awk -F "[_;]" '{print $2}' a
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摘要：001、match >>> import re >>> str1 = "www.baidu.com" ## 测试字符串 >>> re.match("www", str1) <re.Match object; span=(0, 3), match='www'> >>> re.match("www",
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摘要：001、shell实现 [root@pc1 test2]# ls a.txt [root@pc1 test2]# cat a.txt ## 测试数据 1 4 6 10 8 16 17 20 [root@pc1 test2]# cat a.txt | tr " " "\n" | sed -e '1d'
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摘要：001、shell实现 [root@pc1 test2]# ls a.txt [root@pc1 test2]# cat a.txt ## 测试数据 a 8 b 3 a 9 a 2 b 3 c 7 c 2 c 10 [root@pc1 test2]# for i in a b c; do grep
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摘要：001、 [root@pc1 test2]# ls a.txt [root@pc1 test2]# cat a.txt ## 测试数据 ab cd kk jj ee rr tt tt ss nn bb rr [root@pc1 test2]# rev a.txt | sed 's/ /_/' | r
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摘要：001、 >>> list1 = [("aa",100, 400), ("bb", "kk", "yy"), (33, 400, 500)] >>> for i, j, k in list1: ## 利用列表、元组同时传入多个参数 ... print(i,k) ... aa 400 bb yy 33
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摘要：001、 直接使用字典进行统计 >>> str1 = "aaaabbcdddefff" ## 测试字符串 >>> dict1 = dict() >>> for i in str1: ## 利用条件分支进行判断 ... if i in dict1: ... dict1[i] += 1 ... else
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摘要：首先，defaultdict 是 dict 的一个子类。通常 Python 中字典(dict)是通过键值对来存取的，当索引一个不存在的键时，就会引发 keyerror 异常。那么，defaultdict 就可以解决这个问题，它可以实现为不存的键值返回一个默认值。 defaultdict是 colle
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摘要：和map()类似，filter()也接收一个函数和一个序列。和map()不同的时，filter()把传入的函数依次作用于每个元素，然后根据返回值是True还是False决定保留还是丢弃该元素。 >>> def is_odd(n): ... return n % 2 == 1 ... >>> filt
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摘要：map函数会根据提供的函数对指定序列做映射。 通过定义可以看到，这个函数的第一个参数是一个函数，剩下的参数是一个或多个序列，返回值是一个集合。 map的作用是以参数序列中的每一个元素调用function函数，返回包含每次function函数返回值 001、 >>> map(lambda x: x *
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摘要：#-*-coding: UTF-8 -*- 解决python2 中 中文乱码报错的问题 001、 [root@pc1 test1]# ls a.fa test.py [root@pc1 test1]# cat a.fa ## 测试数据 >chr1 xxx aaaggg eeee >chr2 yyy
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摘要：001、 [root@pc1 test1]# ls a.fa test.py [root@pc1 test1]# cat a.fa ## 测试fasta文件 >chr1 kkk aattttt cccc >chr2 yyy ttttuuuu ddfff >chr3 eee uuuuukk sssff
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摘要：001、 [root@pc1 test2]# ls a.fa test.py [root@pc1 test2]# cat a.fa ## 测试fasta文件 >chr1 aattggggc ssff xx >chr2 uuuttcccccc >chr3 ggggcccc tttt [root@pc1
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摘要：001、 [b20223040323@admin1 test]$ ls ## 测试gff文件 exons_only.gff [b20223040323@admin1 test]$ gff2bed <exons_only.gff > exons_only.bed ## gff2bed模块转换 Warn
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摘要：001、 [root@pc1 test2]# ls a.txt [root@pc1 test2]# cat a.txt ## 测试数据 NC_003074.8 1000177 1000243 exon141402 NC_003074.8 1000177 1000243 exon141414 NC_0
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摘要：001、gff3文件转bed [root@pc1 test2]# ls Capra_hircus.ARS1.108.gff3 [root@pc1 test2]# gff2bed <Capra_hircus.ARS1.108.gff3 > test.bed Warning: If your Wiggl
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摘要：001、问题 /usr/bin/ld: cannot find -lm 002、解决方法 yum install glibc-static
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摘要：001、问题 File "/usr/bin/yum", line 30 002、问题原因 yum采用python作为命令解释器，系统自带的为python2.7， 安装了python3版本，造成不匹配 003、解决办法 修改/usr/bin/yum，把#!/usr/bin/python修改为#!/us
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摘要：Lambda函数用于创建匿名函数： 001、 >>> add1 = lambda x: x+2 >>> add1(100) 102 >>> add1(50) 52 >>> abc = lambda x: x * 2 >>> abc(10) 20 >>> abc(0.8) 1.6
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摘要：001、 格式化数值 >>> "{:.2%}".format(0.123456789) '12.35%' >>> "{:.5%}".format(0.123456789) '12.34568%' >>> "{:.2}".format(0.123456789) '0.12' >>> "{:.5}".f
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摘要：001、 any 只要一个结果为真，结果就为真 >>> any([False, False, True]) True >>> any([False, False, False]) False 002、all 只有所有结果为真才为真 >>> any([False, False, True]) True
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摘要：001、 abs函数取绝对值 >>> abs(100) 100 >>> abs(-500) 500 002、round函数取小数点位数 >>> round(99.95) ## 默认没有小数点 100 >>> round(100.95) 101 >>> round(100.25) 100 >>> ro
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摘要：eval()函数用来执行一个字符串表达式，并返回表达式的值。 001、 >>> a="3+3" >>> type(a) <class 'str'> >>> eval(a) ## eval用于返回字符串的值 6 >>> eval("pow(3,3)") 27 >>> eval("pow(2,3)")
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摘要：利用混合的F2群体研究水稻杂种优势机理的文章于2016年9月以Article的形式发表在Nature上（Huang等，2016），研究人员首先对水稻的杂交种进行分类，综合分类情况，选择17个能代表主要杂种类别的杂交组合发展成F2群体，最终使用10074个F2材料进行关联分析。F2群体包含完整基因型类
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摘要：001、 >>> import os >>> os.path.abspath("2.txt") ## 列出指定文件的绝对路径 '/home/test/2.txt' >>> os.path.abspath("test1") ## 列出指定目录的绝对路径 '/home/test/test1' 002、o
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摘要：001、 [root@pc1 test]# ls a.sh [root@pc1 test]# cat a.sh ## 测试程序 #!/bin/bash for ((i = 1; i <= 3; i++)) do echo " outer loop:$i " for ((j = 1; j <= 3;
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摘要：001、 [root@pc1 test3]# ls GCF_000001405.40_GRCh38.p14_genomic.gff [root@pc1 test3]# awk '$3 == "gene" {split($9, a, ";"); for(i in a) {split(a[i], b,
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摘要：001、基本用法 [root@pc1 test4]# ls a.txt [root@pc1 test4]# cat a.txt a b c d b e a d e z b c a d e [root@pc1 test4]# awk '{print ay[$2]++}' a.txt 0 1 0 2 1
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摘要：001、 >>> import os >>> os.listdir("/home/test") ## 结果返回的是列表 ['a.txt', 'b.txt', 'test1', 'test2', 'test3'] >>>
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摘要：001、 [root@PC1 test]# ls a.txt test.py [root@PC1 test]# cat a.txt ## 测试文件 001 002 003 004 005 006 007 008 009 010 011 012 013 014 015 016 017 018 019
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摘要：001\ [root@pc1 test3]# cat a.fa >chr1 cccccggggggggttttgg cccgggggg >chr2 uuuuutttttNNNNNddffff dddgggggggggggcccccccccc [root@pc1 test3]# cat test.py
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摘要：001、 [root@pc1 test3]# ls a.txt b.txt test.py [root@pc1 test3]# cat a.txt 1 2 3 [root@pc1 test3]# cat b.txt 1 2 3 [root@pc1 test3]# cat test.py ## 测试程
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摘要：001、 [root@pc1 test3]# python2 ## python2 Python 2.7.5 (default, Jun 28 2022, 15:30:04) [GCC 4.8.5 20150623 (Red Hat 4.8.5-44)] on linux2 Type "help",
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摘要：001、 >>> str1 = ">aabbcc" >>> if str1.startswith(">"): ... print("yes") ... yes >>> if not str1.startswith(">"): ## python中if语句取反 ... print("yes") ...
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摘要：001、提取文件的最后几列 [root@pc1 test3]# ls a.txt [root@pc1 test3]# cat a.txt ## 测试文件 001 002 003 004 005 006 007 008 009 010 011 012 013 014 015 016 017 018 0
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摘要：001、 [root@PC1 test1]# ls a.txt [root@PC1 test1]# cat a.txt 001 002 003 004 005 006 007 008 009 010 011 012 013 014 015 016 017 018 019 020 021 022 02
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摘要：-b：以字节为单位进行截取。 -c：以字符为单位进行截取。 001、 [root@PC1 test1]# ls a.txt b.txt [root@PC1 test1]# cat a.txt ewr23436546cfgfd [root@PC1 test1]# cut -b 2 a.txt w [r
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摘要：001、跳转到指定列 n + | （管道） 或者 0nl（小写的L） 002、跳转到行首、行尾 0：行首 $：行尾 home：行首 end：行尾 003、左右移动 nl（小写的L）：向右移动n位 hl（小写的L）：向左移动n位
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摘要：001、问题 解决方法如下： 001、win + i打开设置， 点击隐私与安全性 002、点window安全中心 003、点设备安全性 004、点击内核隔离详细信息 005、将该选项关闭 006、重启计算机、测试，没有问题了。
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摘要：000、问题如下： 001、 002、 003、 004、勾选 005、 参考：https://www.cnblogs.com/zouhuaxin/p/16732666.html
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摘要：001、打包 [root@pc1 test3]# ls a.txt b.txt c.map df110 tmp1 [root@pc1 test3]# tar -cf all.tar * ## 打包 [root@pc1 test3]# ls all.tar a.txt b.txt c.map df11
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