摘要: 001、ls + sed + awk实现 root@PC1:/home/req/input/E.coli/fastq# ls SRR1770413_1.fastq.gz SRR1770413_2.fastq.gz root@PC1:/home/req/input/E.coli/fastq# ls | 阅读全文
posted @ 2022-09-12 19:01 小鲨鱼2018 阅读(1022) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 001、 双端测序下机数据中得到的read1和read2是两条互补链insertsize中方向相对的两条序列,再比对到单链的参考基因组之前会先将其中一条read转义,然后进行比对,所以比对得到的SAM和BAM文件中read1和read2有一条是被转了的。 来源:https://www.jianshu 阅读全文
posted @ 2022-09-12 18:07 小鲨鱼2018 阅读(618) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 001、wc -c 命令: 统计字符数 root@PC1:/home/req/input/test# ls a.txt root@PC1:/home/req/input/test# cat a.txt ## 测试文件 aa bb cc dd ee ff root@PC1:/home/req/inpu 阅读全文
posted @ 2022-09-12 14:58 小鲨鱼2018 阅读(798) 评论(0) 推荐(0) 编辑