摘要: 001、column -t实现 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test6# ls xxx.genome root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test6# cat xxx.genome ## 测试数据 FID1 IID1 FID2 IID2 RT EZ Z0 阅读全文
posted @ 2022-07-13 22:18 小鲨鱼2018 阅读(866) 评论(0) 推荐(1) 编辑
摘要: 基本公式: 001、计算卡方值x^2, 然后根据自由度计算p值。 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test6# ls result.map result.ped root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test6# plink --file result --ha 阅读全文
posted @ 2022-07-13 20:14 小鲨鱼2018 阅读(876) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: plink 软件中--impute-sex参数:基因基因型信息推断性别(x染色体--het参数的F值,female: F < 0.2; male: F > 0.8), 并写入数据。 001、计算f值 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test5# ls outcome.map o 阅读全文
posted @ 2022-07-13 10:20 小鲨鱼2018 阅读(315) 评论(0) 推荐(0) 编辑