01 2022 档案
摘要：1、生成矩阵，使用matrix函数 > set.seed(111) ## 设定随机数种子 > vect <- sample(1:10,16, replace = T) > vect [1] 4 3 9 5 3 8 10 1 10 4 8 10 9 8 1 7 > dat <- matrix(vect
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摘要：1、测试数据 root@PC1:/home/test# ls a.txt root@PC1:/home/test# cat a.txt 2 3 5 d a d g v k z c d e q w r i j m n x z v d f g h 2、转换为3列数据 root@PC1:/home/tes
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摘要：1、测试数据 root@PC1:/home/test2# ls test.txt root@PC1:/home/test2# cat test.txt ## 测试数据 a 3 5 d s g e z 2、sed 实现 root@PC1:/home/test2# ls test.txt root@PC
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摘要：1、测试数据 root@PC1:/home/test2# ls test.txt root@PC1:/home/test2# cat test.txt a 3 5 d s g e z root@PC1:/home/test2# cat -A test.txt a 3 5 d$ s g e z$ 2、
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摘要：1、测试数据 root@PC1:/home/test2# ls test.txt root@PC1:/home/test2# cat test.txt ## 测试数据 a 3 5 d s g e z c g w k z c m d 2、xargs实现（数据大时不适用） root@PC1:/home/
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摘要：1、sqrt > sqrt(4) ## 4的平方根 [1] 2 > sqrt(9) ## 9的平方根 [1] 3 > sqrt(10) ## 10的平方根 [1] 3.162278 2、log > log(100) ## 以e为底， 100的对数 [1] 4.60517 > log10(100) #
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摘要：1、向下取整数floor > a <- 1.1 ## 向下取整数 > floor(a) [1] 1 > a <- 1.9 ## 向下取整数 > floor(a) [1] 1 2、向上取整数ceiling > a <- 1.9 > ceiling(a) ## 向上取整数 [1] 2 > a <- 1.
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摘要：1、取正对角线 root@PC1:/home/test# ls a.txt root@PC1:/home/test# cat a.txt 1 D E 2 s d 3 d c root@PC1:/home/test# awk '{print $NR}' a.txt ## 取矩阵对角线元素，正对角线 1
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摘要：1、 root@PC1:/home/test2# ls a.txt dir.1 test.csv test.ped root@PC1:/home/test2# ls -l total 8 -rw-r--r-- 1 root root 64 1月 21 23:14 a.txt drwxr-xr-x 2
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摘要：1、测试数据 root@PC1:/home/test2# ls a.txt root@PC1:/home/test2# cat a.txt ## 测试数据 chenwu 05/99 4811 27 mary 02/22 1231 30 tom 09/15 1182 25 2、 root@PC1:/h
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摘要：1、测试数据 root@PC1:/home/test# ls ## 测试数据 a.txt b.txt root@PC1:/home/test# cat a.txt w s g d w a root@PC1:/home/test# cat b.txt d a e d t c 2、取两个文件的交集 so
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摘要：1、 root@PC1:/home/test# ls test.txt root@PC1:/home/test# cat test.txt 1 3 8 1 3 5 1 7 root@PC1:/home/test# sort test.txt | uniq -d ## 取出重复项 1 3 root@P
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摘要：1、 > dat1 <- c(1, 2, 3, 4, 5, 6) ## 测试数据 > dat2 <- c(1, 2, 3, 4, 5, 6) ## 测试数据 > lm(dat2~dat1) Call: lm(formula = dat2 ~ dat1) Coefficients: (Intercep
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摘要：R语言caret包中createFolds函数实现将向量随机分组。 1、 > library(caret) > createFolds(1:10, k = 5) ## 将1-10随机分为5组，返回每组的索引 $Fold1 [1] 4 5 $Fold2 [1] 1 3 $Fold3 [1] 2 7 $
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摘要：R语言中set.seed函数的作用是保证两次随机抽样的结果一致。 1、不使用set.seed函数的情况下 > sample(1:8, 3) ## 从1~8中随机抽取3个数字 [1] 3 7 4 > sample(1:8, 3) [1] 4 8 6 > sample(1:8, 3) [1] 1 5 4
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摘要：1、全部替换 > c1 <- c("x", "z", "a", "b") > c2 <- c("a", "ab", "d", "z") > c3 <- c("d", "m", "n", "a") > c4 <- c("x", "a", "m", &qu
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摘要：1、 > dat1 <- 1:8 > dat2 <- 3:10 > setdiff(dat1, dat2) ## 取数据dat1中的唯一项 [1] 1 2 > setdiff(dat2, dat1) ## 取数据dat2中的唯一项 [1] 9 10 2、如果有重复 > dat1 <- c(2, 1,
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摘要：1、测试数值 > dat1 <- 1:8 > dat2 <- 3:10 > intersect(dat1, dat2) ## 直接取两个数值型的交集 [1] 3 4 5 6 7 8 2、数值有重复的情况 > dat1 <- c(2, 3, 2, 4, 5, 3, 6, 3, 4, 8) > dat2
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摘要：R原因中list.files()函数用于列出指定目录下的特定文件。 1、查看当前目录下的所有文件 > dir() [1] "outcome.map" "ped.r" "result.map" "test1.r" "test2.r" "testxx.abcr" > list.files() [1] "
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摘要：直方图： 直观地反映数据在不同区间的频数/频率分布。 1、 > dat <- c(rep(1,10), rep(2,5), rep(3,6)) ## 测试数据 > dat [1] 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 2 2 3 3 3 3 3 3 > hist(dat) ## 直接绘
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摘要：1、一般绘图 > plot(0:10) 2、利用mfrow参数设置 par(mfrow = c(1,2)) ## 设置为一行两列 plot(0:10) plot(0:10) > dev.off() ## 清空设置 null device 1 > par(mfrow = c(1,4)) ## 设置为1
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摘要：1、查看默认值 > getOption("digits") [1] 7 ## 默认显示是7位 2、测试 > a = 1.12345 > a ## a为6位，正常显示 [1] 1.12345 > a = 1.123456 > a ## a为7位， 正常显示 [1] 1.123456 > a = 1.1
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摘要：1、问题 > dis <- seq(100000, 10000000, 100000) > head(dis) ## 为什么以科学计数法显示？ [1] 1e+05 2e+05 3e+05 4e+05 5e+05 6e+05 2、测试 > a = 10000 > a [1] 10000 > a = 1
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摘要：1、 root@PC1:/home/test# ls test.sh root@PC1:/home/test# cat test.sh #!/bin/bash #using a function in a script function func1 { ## shell自定义函数的格式之一是 fun
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摘要：1、 root@PC1:/home/test# ls root@PC1:/home/test# for i in {A..D}; do for j in {A..D}; do echo $i"_"$j; done; done ## 生成A-D任意的两两组合 A_A A_B A_C A_D B_A B
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摘要：linux 中awk命令实现统计频数 1、 root@PC1:/home/test# ls a.txt root@PC1:/home/test# cat a.txt 3 4 6 3 2 4 8 2 1 5 6 2 4 3 6 1 2 4 7 3 3 4 7 2 root@PC1:/home/test
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摘要：1、循环数字 root@PC1:/home/test# ls root@PC1:/home/test# for((i = 1; i <= 5; i++)); do echo $i; done 1 2 3 4 5 2、 root@PC1:/home/test# ls root@PC1:/home/te
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摘要：1、获取环境变量 export env 2、测试export 和 env： root@PC1:/home/test# ls root@PC1:/home/test# export > export.txt ## 生成文件 root@PC1:/home/test# ls export.txt root
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摘要：1、测试数据 root@PC1:/home/test# ls test.txt root@PC1:/home/test# cat test.txt 3 4 2 2 1 9 5 7 5 7 8 4 2 3 4 6 2、统计每行数据的最大值 root@PC1:/home/test# ls test.tx
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摘要：1、测试数据 root@PC1:/home/test# ls test.txt root@PC1:/home/test# cat test.txt 3 4 2 2 1 9 5 7 5 7 8 4 2 3 4 6 2、实现计算每行的和 root@PC1:/home/test# ls test.txt
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摘要：1、测试数据 root@PC1:/home/test# ls test.txt root@PC1:/home/test# cat test.txt 3 4 2 2 1 9 5 7 5 7 8 4 2 3 4 6 2、输出每一列的最大值 root@PC1:/home/test# ls test.txt
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摘要：1、测试数据 root@PC1:/home/test# ls test.txt root@PC1:/home/test# cat test.txt 3 4 2 9 1 3 5 4 3 7 8 4 2 3 4 6 2、对每一列数据进行求和 root@PC1:/home/test# ls test.tx
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摘要：在终端实现计算功能 1、在终端直接使用 root@PC1:/home/test# bc ## 在终端直接输入bc进入 bc 1.07.1 Copyright 1991-1994, 1997, 1998, 2000, 2004, 2006, 2008, 2012-2017 Free Software
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摘要：linux中date命令用于获取当前的日期 1、 root@PC1:/home/test# date ##在终端直接输入date即可获取当前的日期信息 2022年 01月 14日 星期五 12:30:42 CST 2、 root@PC1:/home/test# date +%Y ##年 2022 r
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摘要：1、测试数据 root@PC1:/home/test# ls a.txt test.txt root@PC1:/home/test# cat test.txt 3 s j d z 4 x c 8 3 f z c m d root@PC1:/home/test# cat a.txt 1 2 3 2、
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摘要：1、测试数据 root@PC1:/home/test# ls test.map root@PC1:/home/test# cat test.map 01 SNP01 55910 02 SNP02 85204 03 SNP03 122948 04 SNP04 203750 05 SNP05 31270
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摘要：1、安装virtualbox虚拟机软件 官网：https://www.virtualbox.org/ ， 下载后直接双击安装即可 2、下载centos镜像文件 下载地址：http://mirrors.njupt.edu.cn/centos/7.9.2009/isos/x86_64/ ，这里选择的是c
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摘要：1、问题 2、查看linux版本 [root@localhost test]# cat /etc/redhat-release CentOS Linux release 7.9.2009 (Core) 3、解决方法 step1： [root@localhost test]# yum update k
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摘要：1、测试数据 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# ls a.map root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# cat a.map ##测试数据 1 s64199.1 0 55910 1 OAR19_64675012.1 0 85204 1 O
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摘要：1、测试数据 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# ls a.txt root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# cat a.txt aa 2413 bb 3322 cc 4231 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2
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摘要：1、-k 指定域 + 位置 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# ls a.txt root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# cat a.txt ## 测试数据 google 110 5000 baidu 100 5000 guge 50 3000
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摘要：1、测试数据 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# ls a.txt root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# cat a.txt 01 02 03 04 05 06 07 08 09 11 12 13 14 15 16 17 18 19 2、实现
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摘要：1、测试数据 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# ls a.txt root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# cat a.txt 01 11 02 12 03 13 04 14 05 15 06 16 07 17 08 18 09 19 10 2
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摘要：1、 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# ls outcome.map root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# gzip -c outcome.map > test.gz ## 压缩并保留源文件 root@DESKTOP-1N42TVH:/
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摘要：1、 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# ls outcome.map root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# cat outcome.map ## 测试数据 1s64199.1055910 1OAR19_64675012.1085204 1O
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摘要：1、ls + grep + xargs 实现 a、 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# touch test{1..10}.txt root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# touch abc{1..10}.csv root@DESKTOP-1N
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摘要：1、 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# ls a.txt root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# cat a.txt i A Em F d q ddd M d e N ffff i A Em F d q ddd M d e N ffff ro
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摘要：1、R实现 test <- c(20,50,40,60,80) ## 测试数据 coordinate <- vector() base <- 0 temp <- 0 for (i in 1:length(test)) { temp <- base + 0.5 * test[i] coordinate
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摘要：1、测试数据 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# ls a.txt root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# cat a.txt d e u d m k j a d c x s k f root@DESKTOP-1N42TVH:/home/tes
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摘要：1、测试数据 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# ls a.txt root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# cat a.txt i A E F d q d M d e N f root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# c
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摘要：1、测试数据 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# ls a.txt root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# cat a.txt d w g s d s dd d g r d gg d ge root@DESKTOP-1N42TVH:/home/
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摘要：1、测试数据 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# ls outcome.map root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# cat -A outcome.map ## 末尾多出^M 1^Is64199.1^I0^I55910^M$ 1^IOAR
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摘要：tr用来转换或者删除一段文字。 1、实现大小写转换 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# ls a.txt root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# cat a.txt ## 测试数据 i A E F d q J M S e N f root@DE
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摘要：1、 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# ls test.txt root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# cat test.txt chr1 snp1 0 55910 chr1 snp2 0 85204 chr1 snp3 0 122948 c
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摘要：1、sub、gsub root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# ls test.txt root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# cat test.txt ## 测试数据 a 3 3 s 1 j z c m q e i 3 4 k h f 3 root
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摘要：1、直接测试 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# ls test.txt root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# cat test.txt ##测试数据 a 3 3 a 3 3 s 1 j s 1 j z c m z c m q e i q e
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摘要：linux awk忽略大小写 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# ls test.txt root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# cat test.txt a 3 d Q 1 j z c m q e i 3 4 Q A f 3 root@DES
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摘要：1、测试数据 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# ls test.txt test2.txt root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# cat test.txt a 3 d s 1 j z c m q e i 3 4 k h f 3 root@D
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摘要：1、测试数据及脚本 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# ls test.py test.txt root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# cat test.txt a 3 d s 1 j z c m q e i 3 4 k h f 3 root@
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摘要：1、测试数据及脚本 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# ls test.py test.txt root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# cat test.txt a 3 d s 1 j z c m q e i 3 4 k h f 3 root@
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摘要：1、测试数据 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# cat test.txt Chr1 Chr11 Chr7 Chr8 Chr10 Chr2 Chr5 Chr3 Chr4 Chr12 Chr6 Chr9 2、排序 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/t
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摘要：1、问题安装bedtools 执行make命令是报错fatal error: lzma.h: No such file or directory root@DESKTOP-1N42TVH:/home/software/bedtools2# ls LICENSE Makefile README.md
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摘要：1、执行make动作时出现如下问题 cram/cram_io.c:57:10: fatal error: bzlib.h: No such file or directory root@DESKTOP-1N42TVH:/home/software/bedtools2# ls LICENSE Make
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摘要：1、测试数据 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test/test# cat test.txt 2013 2014 2013 2014 1 1.3 0 0 0.9 1.7 0 0 0.9 1.3 4.2 0.9 1 1.6 0 0.9 0 1.6 0 0.9 0.9 1.2 0
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摘要：1、内核版本 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/software/PopLDdecay# cat /etc/issue Ubuntu 20.04.3 LTS \n \l root@DESKTOP-1N42TVH:/home/software/PopLDdecay# cat /pr
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摘要：1、问题 Err:12 http://security.ubuntu.com/ubuntu focal-updates/main amd64 openjdk-11-jre-headless amd64 11.0.11+9-0ubuntu2~20.04 404 Not Found [IP: 91.18
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