测序中的GC偏好

 

001、

测序中的GC偏好指的是基因组上GC含量在50%左右的区域更容易被测到,产生的reads更多,这些区域的覆盖度更高,在高GC或者低GC区域,不容易被测到,产生较少的reads,这些区域的覆盖度更少。基因组单位长度bin中的GC含量作为横坐标,覆盖度作为纵坐标作图,可以明显的看到该趋势。这种趋势在100kb为单位的bin中依然存在。

 

 

来源:

01、https://zhuanlan.zhihu.com/p/512061064

 

posted @   小鲨鱼2018  阅读(26)  评论(0编辑  收藏  举报
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