Exception in thread "Thread-0" java.lang.RuntimeException: Sequence and quality length don't match:

 

001、问题

Exception in thread "Thread-0" java.lang.RuntimeException: Sequence and quality length don't match:

 

002、 出现这个问题的原因是原始fastq文件损坏，需要重新下载
a、通过解压原始gz文件判断：

(base) [b20223040323@admin2 x_test]$ gunzip ERR12389568_2.fastq.gz

gzip: ERR12389568_2.fastq.gz: invalid compressed data--crc error

gzip: ERR12389568_2.fastq.gz: invalid compressed data--length error

 

说明gz文件时损坏的，需要重新下载。