samtools各种flag的含义

 

https://blog.csdn.net/crewkickse/article/details/131513734

 

4: 代表这个序列没有mapping到参考序列上

8: 代表这个序列的另一端序列没有比对到参考序列上,比如这条序列是R1,它对应的R2端序列没有比对到参考序列上

 

64 : 代表这个序列是R1端序列, read1;

128 : 代表这个序列是R2端序列,read2;

 

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