cdhit-common.h:39:17: fatal error: zlib.h: No such file or directory

 

001、问题

cd-hit 编译报错如下：

cdhit-common.h:39:17: fatal error: zlib.h: No such file or directory

 

002、解决方法

yum -y install zlib zlib-devel

 

003、验证

[root@pc1 cd-hit-v4.8.1-2019-0228]# make
g++  -fopenmp -DWITH_ZLIB -O2  cdhit-common.c++ -c
g++  -fopenmp -DWITH_ZLIB -O2  cdhit-utility.c++ -c
g++  -fopenmp -DWITH_ZLIB -O2  cdhit.c++ -c
g++  -fopenmp -DWITH_ZLIB -O2  cdhit.o cdhit-common.o cdhit-utility.o -lz -o cd-hit
g++  -fopenmp -DWITH_ZLIB -O2  cdhit-est.c++ -c
g++  -fopenmp -DWITH_ZLIB -O2  cdhit-est.o cdhit-common.o cdhit-utility.o -lz -o cd-hit-est
g++  -fopenmp -DWITH_ZLIB -O2  cdhit-2d.c++ -c
g++  -fopenmp -DWITH_ZLIB -O2  cdhit-2d.o cdhit-common.o cdhit-utility.o -lz -o cd-hit-2d
g++  -fopenmp -DWITH_ZLIB -O2  cdhit-est-2d.c++ -c
g++  -fopenmp -DWITH_ZLIB -O2  cdhit-est-2d.o cdhit-common.o cdhit-utility.o -lz -o cd-hit-est-2d
g++  -fopenmp -DWITH_ZLIB -O2  cdhit-div.c++ -c
g++  -fopenmp -DWITH_ZLIB -O2  cdhit-div.o cdhit-common.o cdhit-utility.o -lz -o cd-hit-div
g++  -fopenmp -DWITH_ZLIB -O2  cdhit-454.c++ -c
g++  -fopenmp -DWITH_ZLIB -O2  cdhit-454.o cdhit-common.o cdhit-utility.o -lz -o cd-hit-454

 。

参考：https://blog.csdn.net/wu10188/article/details/130846491