NCBI中根据sra号下载数据

 

001、如果可行,最方便, 直接生成fastq格式数据

fastq-dump --split-files SRR1770413

 

002、

a、下载sra格式数据

prefetch SRR1770413

 

b、转换为fastq格式

fastq-dump --gzip --split-files SRR1770413.sra

 

003、

a、

 

b、

 

c、

wget https://sra-downloadb.be-md.ncbi.nlm.nih.gov/sos5/sra-pub-zq-11/SRR001/770/SRR1770413/SRR1770413.sralite.1

 

d、然后再转换为fastq格式

fastq-dump --gzip --split-files SRR1770413.sra

 

posted @ 2023-05-14 23:32  小鲨鱼2018  阅读(90)  评论(0编辑  收藏  举报