linux 中 awk命令实现将fasta文件中每个scaffold中的所有碱基转换为一行
001、
[b20223040323@admin1 test]$ ls test.fa [b20223040323@admin1 test]$ cat test.fa ## 测试数据 >chr1 aabbccdd eeff >chr2 xxyyzzqq gg >chr3 ddjjiill ssff ## 转换程序 [b20223040323@admin1 test]$ awk '{if(NR == 1) {print $0} else if($0 ~ />/) {printf("\n"); print $0} else {printf("%s", $0)}} END {printf("\n")}' test.fa >chr1 aabbccddeeff >chr2 xxyyzzqqgg >chr3 ddjjiillssff