linux中awk命令从fasta中提取指定的scaffold
001、
[root@pc1 test4]# ls test.fa [root@pc1 test4]# cat test.fa ## 测试fasta文件 >mmm 11111 >bbb 888888 7777 >kkk 6666666 99999 >qqq 0000 33333 [root@pc1 test4]# awk '/>/ {p=($0 ~ "kkk")} p' test.fa >kkk 6666666 99999 [root@pc1 test4]# awk '/>/ {p=($0 ~ "qqq")} p' test.fa >qqq 0000 33333
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linux shell
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