linux 中输出参考基因组gff文件第9列的注释类别
001、
[root@pc1 test3]# ls GCF_000001405.40_GRCh38.p14_genomic.gff [root@pc1 test3]# awk '$3 == "gene" {split($9, a, ";"); for(i in a) {split(a[i], b, "="); if(++c[b[1]] == 1) print b[1]}}' GCF_000001405.40_GRCh38.p14_genomic.gff description ID Dbxref Name gbkey gene gene_biotype gene_synonym partial start_range end_range
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linux shell
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