如何检测bam文件的完整性
001、
[root@pc1 test]# ls E_coli_K12.sorted.markdup.bam ## 测试bam文件 [root@pc1 test]# samtools quickcheck E_coli_K12.sorted.markdup.bam ## 使用samtools quickcheck命令 [root@pc1 test]# ls E_coli_K12.sorted.markdup.bam [root@pc1 test]# head -n 1000 E_coli_K12.sorted.markdup.bam > a.bam ## 提取完整bam文件的一部分作为测试文件 [root@pc1 test]# ls a.bam E_coli_K12.sorted.markdup.bam [root@pc1 test]# samtools quickcheck a.bam ## 测试 a.bam was missing EOF block when one should be present ## 不完整