单细胞数据分析-数据的标准化 NormalizeData函数

 

001、

pbmc <- NormalizeData(pbmc)

 

002、实现过程

dat <- pbmc[["RNA"]]@counts
dat <- as.data.frame(dat)

for (i in 1:ncol(dat)) {
  dat[,i] <- log1p(dat[,i]/sum(dat[,i]) * 10000)
}
tail(dat)[, 1:5]