linux 系统中如何匹配指定数目的连续多个字符

 

1、测试数据

root@PC1:/home/test2# ls
test.txt
root@PC1:/home/test2# cat test.txt
attatgcccagggtttgttacttcagatgtgtccagagtttctcccttct
ggcaggttcatggtcttgctcacttcaagaatgaagctgcagacatttac
ggtgagtgttacagcacttatatttgttgtatccagagtttgttccttca
gatgtgtccagaatttcttccttctggcgggttcatggtcttgctcactt

 

2、提取前10个字符(连续匹配)

root@PC1:/home/test2# ls
test.txt
root@PC1:/home/test2# cat test.txt
attatgcccagggtttgttacttcagatgtgtccagagtttctcccttct
ggcaggttcatggtcttgctcacttcaagaatgaagctgcagacatttac
ggtgagtgttacagcacttatatttgttgtatccagagtttgttccttca
gatgtgtccagaatttcttccttctggcgggttcatggtcttgctcactt
root@PC1:/home/test2# sed 's/[a-z]\{10\}/& /' test.txt                          ## 匹配前10个字符
attatgccca gggtttgttacttcagatgtgtccagagtttctcccttct
ggcaggttca tggtcttgctcacttcaagaatgaagctgcagacatttac
ggtgagtgtt acagcacttatatttgttgtatccagagtttgttccttca
gatgtgtcca gaatttcttccttctggcgggttcatggtcttgctcactt
root@PC1:/home/test2# sed 's/[a-z]\{10\}/& /' test.txt | awk '{print $1}'       ## 提取前10个字符
attatgccca
ggcaggttca
ggtgagtgtt
gatgtgtcca

 

3、提取后10个字符(连续匹配)

root@PC1:/home/test2# ls
test.txt
root@PC1:/home/test2# cat test.txt
attatgcccagggtttgttacttcagatgtgtccagagtttctcccttct
ggcaggttcatggtcttgctcacttcaagaatgaagctgcagacatttac
ggtgagtgttacagcacttatatttgttgtatccagagtttgttccttca
gatgtgtccagaatttcttccttctggcgggttcatggtcttgctcactt
root@PC1:/home/test2# sed 's/[a-z]\{10\}$/ &/' test.txt                         ## 匹配后10个字符
attatgcccagggtttgttacttcagatgtgtccagagtt tctcccttct
ggcaggttcatggtcttgctcacttcaagaatgaagctgc agacatttac
ggtgagtgttacagcacttatatttgttgtatccagagtt tgttccttca
gatgtgtccagaatttcttccttctggcgggttcatggtc ttgctcactt
root@PC1:/home/test2# sed 's/[a-z]\{10\}$/ &/' test.txt | awk '{print $NF}'     ## 提取后10个字符
tctcccttct
agacatttac
tgttccttca
ttgctcactt

 

posted @ 2022-05-05 17:19  小鲨鱼2018  阅读(787)  评论(0编辑  收藏  举报