linux shell实现将每隔一个空格的两列并排为一列

1、测试数据

root@PC1:/home/test# ls
outcome.ped
root@PC1:/home/test# cat outcome.ped     ## 测试数据， 将每隔一个空格的两列并排为一列
G G C C G G G G G A A A G G G C
G G G C G G G G G G A A A G C C
G G C C G G G G G G A A A G G C
G G C C G G G G G G A A G G G G
G G C C G G G G G G A A A G G C
G G C C G G G G G G A A A A C C
G G C C G G A G A A A A G G C C
G G C C G G A G A A A A G G C C
root@PC1:/home/test# cp outcome.ped outcome.ped_bak   ## 备份数据
root@PC1:/home/test# ls
outcome.ped  outcome.ped_bak

 

2、sed实现

root@PC1:/home/test# ls
outcome.ped  outcome.ped_bak
root@PC1:/home/test# cat outcome.ped    ## 测试数据
G G C C G G G G G A A A G G G C
G G G C G G G G G G A A A G C C
G G C C G G G G G G A A A G G C
G G C C G G G G G G A A G G G G
G G C C G G G G G G A A A G G C
G G C C G G G G G G A A A A C C
G G C C G G A G A A A A G G C C
G G C C G G A G A A A A G G C C
root@PC1:/home/test# let num=$(head -n 1 outcome.ped | awk '{print NF}')/2   ## 统计列数并确定需要替换的列数
root@PC1:/home/test# echo $num
8
root@PC1:/home/test# for i in `seq $num`; do sed "s/ //$i" outcome.ped -i; done   ## 利用sed替换
root@PC1:/home/test# ls
outcome.ped  outcome.ped_bak
root@PC1:/home/test# cat outcome.ped   ## 查看替换效果
GG CC GG GG GA AA GG GC
GG GC GG GG GG AA AG CC
GG CC GG GG GG AA AG GC
GG CC GG GG GG AA GG GG
GG CC GG GG GG AA AG GC
GG CC GG GG GG AA AA CC
GG CC GG AG AA AA GG CC
GG CC GG AG AA AA GG CC

 

3、awk 实现

root@PC1:/home/test# ls
outcome.ped
root@PC1:/home/test# cat outcome.ped
G G C C G G G G G A A A G G G C
G G G C G G G G G G A A A G C C
G G C C G G G G G G A A A G G C
G G C C G G G G G G A A G G G G
G G C C G G G G G G A A A G G C
G G C C G G G G G G A A A A C C
G G C C G G A G A A A A G G C C
G G C C G G A G A A A A G G C C
root@PC1:/home/test# cp outcome.ped outcome.ped_bak   ## 备份数据
root@PC1:/home/test# ls
outcome.ped  outcome.ped_bak
root@PC1:/home/test# awk '{for(i = 1; i <= NF; i++) if(i % 2 != 0) {printf("%s", $i)} else {printf("%s ", $i)}; printf("\n")}' outcome.ped ## 利用awk列循环判断实现
GG CC GG GG GA AA GG GC
GG GC GG GG GG AA AG CC
GG CC GG GG GG AA AG GC
GG CC GG GG GG AA GG GG
GG CC GG GG GG AA AG GC
GG CC GG GG GG AA AA CC
GG CC GG AG AA AA GG CC
GG CC GG AG AA AA GG CC