sratoolkits软件的安装 cdb-config:command not found 解决方法

1、在ncbi下载sratools软件 

  

 

 

 

wget https://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sdk/2.10.8/sratoolkit.2.10.8-centos_linux64.tar.gz
tar -xzvf sratoolkit.2.10.8-centos_linux64.tar.gz
cd sratoolkit.2.10.8-centos_linux64
cd bin
./vdb-config --interactive

  运行以上命令行,开始进行配置:

 

 

 用键盘输入f,出现以下界面:

 

 用键盘 enter:

 

 

 继续enter:

 

 

 

用键盘敲x:

 

 

敲enter:

 

 

敲enter后,则返回命令行界面:

 

 

测试:

 

可以使用了。

加入环境变量:

echo "export PATH=$PATH:/home/software/sratoolkit.2.10.8-centos_linux64/bin" >> /etc/profile
source /etc/profile

 

posted @ 2020-09-26 20:04  小鲨鱼2018  阅读(1993)  评论(0编辑  收藏  举报