sratoolkits软件的安装 cdb-config:command not found 解决方法
1、在ncbi下载sratools软件
wget https://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sdk/2.10.8/sratoolkit.2.10.8-centos_linux64.tar.gz
tar -xzvf sratoolkit.2.10.8-centos_linux64.tar.gz
cd sratoolkit.2.10.8-centos_linux64
cd bin
./vdb-config --interactive
运行以上命令行,开始进行配置:
用键盘输入f,出现以下界面:
用键盘 enter:
继续enter:
用键盘敲x:
敲enter:
敲enter后,则返回命令行界面:
测试:
可以使用了。
加入环境变量:
echo "export PATH=$PATH:/home/software/sratoolkit.2.10.8-centos_linux64/bin" >> /etc/profile
source /etc/profile