linux hedhat8 安装 java环境

1、在使用gatk 构建 索引文件过程中报错如下：

 

 

 

2、查看java 

  

java
java --version
echo $JAVA_HOME
rpm -qa|grep jdk

 

 

 

 

 

 

 

发现没有安装java。

3、下载安装java  

  下载地址 https://www.oracle.com/java/technologies/javase-jdk15-downloads.html，选择对应版本

 

 

 

 

 

 

4、给与权限

 

chmod 777 jdk-15_linux-x64_bin.rpm

 

 

 

 

5、安装

   

rpm -ivh jdk-15_linux-x64_bin.rpm

 

 

 

6、验证是否能用 

   

java
java --version
echo $JAVA_HOME
rpm -qa|grep jdk

 

   

 

 

 

  

 

 

 

 

 

    

 

  貌似已经可以使用。

7、使用gatk构建索引

  

 

   可以正常使用了。