随笔分类 - 生信
摘要：1、准备测试数据，8个样本，8个位点 [root@linuxprobe test]# cat outcome.ped DOR 1 0 0 0 -9 A G G G G G G C G G C C C C 0 0 DOR 2 0 0 0 -9 G G G G A G C C G G G C C C 0
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摘要：1、准备测试数据10个样本，10个位点 [root@linuxprobe test]# ls test.map test.ped [root@linuxprobe test]# cat test.ped ## 10个样本，10行 DOR sample01 0 0 0 -9 G G C C G G G
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摘要：1、准备测试数据 [root@linuxprobe test]# ls test.map test.ped [root@linuxprobe test]# wc -l * ## 46827个位点，60个样本 46827 test.map 60 test.ped 46887 total [root@l
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摘要：1、使用beagle填充遇到如下报错： 2、原因是有两个相邻位点出现如下全部杂合基因型组合： 目前原因未知。
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摘要：1、下载、安装 phylip软件 官网： http://evolution.genetics.washington.edu/phylip.html wget http://evolution.gs.washington.edu/phylip/download/phylip-3.697.tar.gzt
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摘要：1、使用一下命令 编译中出现报错： ./configure 查了一下资料，大概是PKG_CONFIG_PATH这个环境变量出了问题，找不到软件安装过程中依赖包的位置。 在PKG_CONFIG_PATH变量指定路径中，应该有库的名称加.pc的文件。 以下就是排查过程： a、首先看下这个变量到底是什么：
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摘要：1、首先声明 vcftools 软件的安装需要 root 权限 。 2、下载vcftools软件安装包 ：https://github.com/vcftools/vcftools/releases wget https://github.com/vcftools/vcftools/releases/
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