[0基础学R语言] 软件下载与环境配置

Anaconda的下载与环境配置

下载软件

这里采用anaconda主要是为了借用里面自带的jupyter notebook，以及后续可以傻瓜式操作配置R语言环境，相对于其他方法更适合0基础的学习者。

下载链接：Windows 64位版自动下载。因为官方下载链接比较慢，所以这里采用的是清华大学开源镜像站。

下载完后就打开安装包，安装就好啦，然后是安装过程中的几个注意事项：

1. 选择“All Users”。

2.  如果有软件分盘安装的习惯，记得自定义软件安装路径。提醒一下，这个需要比较大的空间（建议当10个G），最好选择空间比较大的磁盘（不建议放C盘）

   

3. 这页全部勾选。

   

    

4. 安装完成，最后界面中两个都取消勾选，我觉得你不会想去看这个官方学习文件

   

    

环境变量配置

直接按win键，通过搜索的方式找到找到“环境变量”修改的地方。

或者通过“此电脑----->属性----->高级系统设置----->环境变量”找到。

选择配置系统变量，找到在列表里找到“Path”，选中后点击编辑会出现如下窗口，然后点击新建，输入如下内容（注意！这里的文件目录要跟你前面下载文件目录一样）：

D:\Anaconda 
D:\Anaconda\Scripts 
D:\Anaconda\Library\mingw-w64\bin
D:\Anaconda\Library\usr\bin 
D:\Anaconda\Library\bin

设置完记得点确定，让环境变量修改成功。

• 验证是否配置成功：按win键，搜索 Anaconda prompt，打开命令行窗口，输入：

  conda --version
  conda info

  出现类似下图即为成功。

  

找到前面截图中所显示的.condarc文件（即C:\Users\yst\.condarc），选择用记事本打开，删除原先的内容，将下面的文本复制进去，然后保存文件。

channels:
  - defaults
show_channel_urls: true
default_channels:
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/r
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/msys2
custom_channels:
  conda-forge: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  msys2: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  bioconda: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  menpo: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  pytorch: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  pytorch-lts: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  simpleitk: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud

在Anaconda的基础上配置R语言内核

首先，需要下载R的内核，R 4.1.3版本下载链接

下载完后打开

输入：install.packages('IRkernel')

会提示你选择一个镜像网站，你选择一个China范围内，地理位置上离你最近的就行。

 然后输入：IRkernel::installspec()

关闭该窗口吧，它的使命结束了

 配置jupyter notebook

默认文件目录修改：

在开始菜单里找到并打开Anaconda Prompt，输入

jupyter notebook --generate-config

然后打开配置文件 C:\Users\Administrator\.jupyter\jupyter_notebook_config.py （根据实际情况而定，不一定是Administrator），如果没有配置python环境，可以用记事本打开

通过查找（快捷键：Ctrl+F），确定所需要修改的行，查找内容： #c.NotebookApp.notebook_dir = '' 

删去‘#’符号，在单引号内粘贴你所期望的文件路径，如下图：

 再找到jupyter的快捷方式，右键，点击“属性”，删去末尾的"%USERPROFILE%/"，点击确定。

jupyter nbextensions插件配置

 在开始菜单里找到并打开Anaconda Prompt，输入

pip install jupyter_contrib_nbextensions
jupyter contrib nbextension install --user

• 我这里出现了提示“Jupyter command jupyter-contrib not found.”
  最后解决方案如下：
  打开Anaconda Prompt，输入

  pip uninstall jupyter_contrib_nbextensions
  pip uninstall jupyter_nbextensions_configurator

  中间如果需要确认就输入y

  然后再输入

  pip install -U "notebook<5.0" -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple

  此时jupyter已经成功出现了nbextensions

jupyter nbextensions的使用

启动jupyter：，会弹出网页界面，注意！状态栏的jupyter不能关掉，不然进程就会挂掉。

这里附上一个jupyter界面的介绍博客：Jupyter Notebook最详指南：入门+安装+扩展_Yummyik的博客-CSDN博客，可以快速了解这个软件的使用方式。

关于插件，我推荐的是这几个：

 然后就可以开始快乐学习啦（终于）