liu_shaobo - 博客园

Slurm和K8S

摘要： 1、观点差异 K8s专为管理长时间运行的流程而构建的协调多个微服务，扩展、管理可用性，通常支持一个或多个web服务云原生系统假设有"infinite"可用资源优先级不是云编排的核心，体现在调度语义上，"Affinity"与"Anti-Affinity"设置不能转换为批处理工作流程 HPC系统假阅读全文

posted @ 2023-08-09 09:45 liu_shaobo 阅读(2725) 评论(0) 推荐(0) 编辑

Slurm执行的CPU管理步骤

摘要： Slurm使用四个基本步骤来管理一个job/step的CPU资源：步骤1：节点选择Slurm选择向作业或作业步骤分配CPU资源的节点集。节点选择受到许多控制CPU分配的配置和命令行选项的影响(下面的步骤2)。如果配置了SelectType=select/linear，则所选节点上的所有资源都将分配阅读全文

posted @ 2023-04-16 21:54 liu_shaobo 阅读(487) 评论(0) 推荐(0) 编辑

谁在使用SLURM

摘要： Slurm在世界上许多最强大的计算机上提供工作负载管理。在2013年11月的Top500榜单上，排名前十的系统中有五个使用Slurm，包括排名第一的系统。仅这五个系统就包含超过570万个核心。下面列出了一些使用Slurm的系统：天河二号由中国国防科技大学(NUDT)设计，拥有16000个节点，每个阅读全文

posted @ 2023-04-09 17:04 liu_shaobo 阅读(98) 评论(0) 推荐(0) 编辑

Slurm的命令

摘要： sacct用于报告有关活动或已完成作业的作业或作业步的记账信息。 salloc用于实时为作业分配资源。通常用于分配资源和生成shell。然后使用shell执行srun命令来启动并行任务。 sattach用于将标准输入，输出和错误以及信号功能附加到当前正在运行的作业或作业步。可以多次附加到作业和从作业阅读全文

posted @ 2023-03-05 18:35 liu_shaobo 阅读(340) 评论(0) 推荐(0) 编辑

Slurm安装快速入门

摘要： 1. 确保时钟、用户和组（UID 和 GID）在集群中同步。 2. 安装MUNGE进行身份验证。确保集群中的所有节点都有相同的munge.key。在启动Slurm守护进程之前，请确保MUNGE守护进程munged已经启动。 3. 解压文件： tar --bzip -x -f slurm*tar.bz 阅读全文

posted @ 2022-06-19 10:21 liu_shaobo 阅读(581) 评论(0) 推荐(0) 编辑

SLURM的PARTITION参数

摘要： PartitionName 分区名 Nodes 节点名 Default=YES 如果没有给作业指明分区，则会分配到默认分区，值时YES或NO。 MaxTime=60 作业运行的最大时间(分钟)限制，INFINITE为没有限制。 DefMemPerNode 每个节点默认分配的内存大小，单位MB，默认值阅读全文

posted @ 2022-05-22 17:29 liu_shaobo 阅读(1647) 评论(0) 推荐(0) 编辑

SLURM调度策略FIFO和Backfill

摘要：阅读全文

posted @ 2022-05-14 10:50 liu_shaobo 阅读(350) 评论(0) 推荐(0) 编辑

SLURM的NODE配置参数

摘要： Slurm节点管理的配置在/etc/slurm.conf文件中指定，更改节点配置(例如添加节点、更改处理器数量等)需要重新启动slurmctld守护进程和slurmd守护进程。所有slurmd守护进程必须知道系统中的每个节点，才能转发消息以支持分层通信。注册到系统的节点的资源少于配置的资源(例如内存阅读全文

posted @ 2022-05-02 09:51 liu_shaobo 阅读(2260) 评论(0) 推荐(0) 编辑

安装VMD 可视分子动力学

摘要： VMD是一种功能强大的分子动力学可视化软件，可使用3D显示图形，设置动画和分析大型生物分子系统。备注：Linux下需要安装桌面<CentOS7.x安装桌面>； 1、下载VMD软件 # wget https://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/vmd-1.9.4/files 阅读全文

posted @ 2022-04-30 10:05 liu_shaobo 阅读(510) 评论(0) 推荐(0) 编辑

OpenBLAS矩阵测试

摘要： 1、OpenBLAS介绍OpenBLAS是一个基于GotoBLAS2 1.13 BSD版本的优化BLAS(基本线性代数子程序)库。由于GotoBLAS维护者Mr. Kazushige离开TACC，GotoBLAS不再维护，因此，张先轶博士创建了OpenBLAS项目。OpenBLAS和MKL性能不相上阅读全文

posted @ 2022-03-19 14:45 liu_shaobo 阅读(997) 评论(0) 推荐(0) 编辑

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