摘要: 做生信的每次学一个软件,需要装一堆东西,而且还对perl或者pyhton的版本有要求。感觉花在软件维护上的时间就很长,要是以后有个超级计算机,每个公司去上面申请个服务器,有个专门的管理员维护就好了,需要什么更新就只要跟管理员说一声就好。 回归正题,更新perl。 1.到perl的官网下一个压缩包:h 阅读全文
posted @ 2017-09-13 14:23 小hunter 阅读(1028) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 需要用过yum安装包,但是我不是管理员。。。 其实这很简单,只要找到root/etc/sudoers这个文件, 用visudo打开,不建议用vim, 因为visudo可以告诉你是否有语法错误。 要求: 比如把yum安装的权限给user1 操作: 1.以root身份登录 2.输入visudo 3.找到 阅读全文
posted @ 2017-09-13 09:10 小hunter 阅读(904) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 在用一个reads的QC软件:ngShoRT, 这个软件需要配套的String::Approx, PerlIO::gzip, 那只能下载这两个软件。ngShoRT的说明书上写的是需要用CPAN下载,试了一下虚拟机上没有CPAN,那句只能先安装一个。从来没有安装过,表示心中无限无奈。 不过发现其实也挺 阅读全文
posted @ 2017-08-31 10:46 小hunter 阅读(1140) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 终于,在经过一段时间的努力,我这个生信菜鸟蛋算是有孵化出来了,经过2年的努力,转行成功。开始我的各种数据,软件,测序之旅。 刚开始阶段,有很多知识需要学习,需要记录,我就记在博客上了。其实生信很多问题,都是在网上搜索到答案,然后解决了的。那我就做个“无火的余烬”, 把小火苗继续传递下去。 昨天装了L 阅读全文
posted @ 2017-05-12 21:28 小hunter 阅读(183) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: Mysql学起来还真的挺好玩的,感觉写代码都不是什么事情,重要的是需要创建好每个表的结构,还有表和表之间的关联关系。 Mysql Linux上的Mysql的操作 mysql的操作 mysql 主要就是对数据库、数据库中个表格还有表格内容进行增删改查。就粘贴一下我的word笔记中的内容了。 数据库 数 阅读全文
posted @ 2017-04-04 12:31 小hunter 阅读(133) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 之前学的通信,异步,现在回过头来看,已经没有那么难,希望以后能排上用场。这个星期学的rabbitmq,redis都是挺好玩的,不过我还没有玩出个花样来。为什么读中学大学时候要抑制女生玩游戏呢,其实女生也是很喜欢玩游戏的,也挺喜欢编程的。 Python 中rabbitmq的主要模块有pika, cel 阅读全文
posted @ 2017-03-25 14:33 小hunter 阅读(178) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 先来回顾一下多线程和多进程把。多线程像是在一个国家内,由A点往B点搬运东西,一条线程就是一条路,多条线程就是开启多条路,然后每条路上可以运输东西。多进程就像多个国家,每个国家里面在执行自己的事情。 然后轮到今天的主角:协程出场 1.携程 corotine, 是一种用户态的轻量级线程,被称为微线程。是 阅读全文
posted @ 2017-03-12 12:52 小hunter 阅读(1358) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 网络真心很抽象,真心很麻烦,Linux都比网络好玩。 1.通信 首先学了一个paramiko, 主要是其中的ssh和sftp. ssh是用来和远程的主机建立连接和通信,sftp可以接收或者发送文件到远程主机。 ssh的代码写法如下: 需要注意的是,ssh.set_missing_host_key_p 阅读全文
posted @ 2017-03-08 13:39 小hunter 阅读(202) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 上周的作业写了单线程的服务端,这周晋级一下,写个多线程的客户端。 主要使用到的就是socketserver,这个模块存在的主要功能就是简化网络服务器的书写。 使用它的主要步骤有: 1.根据BaseRequestHandler创建一个类,并且需要重新定义父类的handler方法 class MyTCP 阅读全文
posted @ 2017-02-26 23:27 小hunter 阅读(209) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 表示编程这条路真得好难走,后悔大学没有读信息专业啊。 第七周的作业: 1. 用户登陆2. 上传/下载文件3. 不同用户家目录不同4. 查看当前目录下文件 刚开始没有一点思路,上网查了很多资料,还自学了FTP。吐槽一句,讲师真是太不负责了,作业要求不详细,还没有思路。 要实现通信,需要7个层次:物理层 阅读全文
posted @ 2017-02-19 22:41 小hunter 阅读(967) 评论(1) 推荐(0) 编辑