发现UCSC可以找到fasta格式的文件,这样就可以保证使用的单个基因的ref序列和整体的hg19序列保持一致了。
找到需要的基因,然后点击这个基因,之后出来的页面中有如下信息。点击Genomic Sequence
然后出来下面这个界面,可以自己调整上下游的区域。然后submit之后就可以看到fasta的文件结果了。
文件结果