R的安装

更新时间：2019.09.23

1. 序言

之前曾经用过一段时间的R(一直忍受着原生R那个超级“简洁”的界面)，但是后来重装了系统并且学习了Python，就没有再怎么碰过R了。然而这两学期又开个R语言的课(统计狗一枚)，只能再重新装一下。
这次有点不同的是，是想直接将R的内核嵌入到jupyter notebook中，用jupyter notebook来写R。为了方便起见，记录一些安装的过程，以便不时之需。

2. R的下载

其实，R的下载十分的简单，一种方法是直接进入R的官网-->选择download R-->选择China的镜像(像清华源)-->Download R for Windows(我的是windows系统)-->选择base版的直接下载就可以了

3. IDE---RStudio

从官网上下载下来的R界面极其“简洁”，除了jupyter notebook以外，我们也可以使用RStudio(从官网上下载，点击安装包，无脑点击下一步就可以了)。当然需要注意的是一定要先安装R，才能使用RStudio。

• ps：从官网上下载RStudio的速度很慢，有时还下不了(毕竟是国外的网站)，也试一下用conda来安装。

3. jupyter notebook中的R内核嵌入

将jupyter notebook中的R内核嵌入主要有两种方法，其中强烈建议anaconda的用户用第一种方法。
方法1：利用anaconda进行安装

1. 安装R的命令：conda install -c r r-essentials，使用这个命令可以直接将R下载并嵌入jupyter notebook中，此外还能对R的各种包进行管理，可谓是一举多得。
2. 安装RStudio的命令：conda install -c r rstudio
3. 安装R的包：conda install -c r r-vcd，以安装vcd包为例
4. 删除R的包：conda remove r-vcd，以删除vcd包为例
5. 更新R的包：conda update r-vcd, 以更新vcd包为例

方法2：手动嵌入R的内核
主要是参考这篇文章：Jupyter Notebook/Lab中添加R Kernel的详细步骤，为了方便查看，把内容转载到下面：

1. 打开R安装相关的包（没有选择镜像的需要选择），输入install.packages(c('repr', 'IRdisplay', 'evaluate', 'crayon', 'pbdZMQ', 'devtools', 'uuid', 'digest'))
2. 安装 IRkernel包，输入devtools::install_github('IRkernel/IRkernel')，其中更新该包时也需要使用devtools::，而R中其他包使用update.packages()命令进行更新即可。

   • 需要先安装devtools，我在linux下直接用install.packages('devtools')一开始没有装上，此时先安装以下部分

     sudo apt-get install gfortran
     sudo apt-get install build-essential 
     sudo apt-get install libxt-dev 
     sudo apt-get install libcurl4-openssl-dev
     sudo apt-get install libxml++2.6-dev
     sudo apt-get install libssl-dev
     

   • 需要安装git

3. 通过intallspec()函数，使Jupyter能找到刚刚安装的R核：
   • 可以直接安装在当前用户中：IRkernel::installspec()
   • 通过设置user=FALSE安装在系统中，建议使用第二种：IRkernel::installspec(user = FALSE)
4. ps：值得注意的是，手动嵌入内核的时候，第三步可能会发生错误，其中一个原因是jupyter与R没有安装在同一个环境