摘要: 原始测序下机数据格式:fasta / fastq 比对(mapping)到参考基因组后数据格式:bam / sam 注释数据格式:gff / gtf / bed 变异数据格式:vcf 关于Fasta Fasta格式也称为Pearson格式,是一种基于文本用于表示核苷酸序列或氨基酸序列的格式。在这种格 阅读全文
posted @ 2017-07-19 13:28 number_5 阅读(2220) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 数据库管理系统,DBMS(database management system),负责数据组织、数据操纵。 数据维护、控制及保护等,对数据库进行管理的软件系统。 数据库的一切操作,如查询、更新、插入、删除以及各种控制,都是通过DBMS进行的。 DBMS是位于用户(或应用程序)和操作系统之间的软件。借 阅读全文
posted @ 2017-07-18 19:41 number_5 阅读(299) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 基本命令 1,cd 切换目录,从根目录开始需要加 "/",从其他目录开始加不加“/”都行,,最后面 加不加 “/”都行 cd.. 返回上级 cd- 返回上次访问 cd~ 返回根目录 2,ls 显示文件和子目录, -l 列出文件详细信息l(list) -a 列出当前目录下所有文件及目录,包括隐藏的a( 阅读全文
posted @ 2017-07-17 21:33 number_5 阅读(384) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 目前生物信息学 的研究情况来看,国际上公认的生物信息学的研究内容,大致包括以下几个方面: 1. 生物信息的收集、存储、管理与提供。包括建立国际基本生物信息库和生物 信息传输的国际联网系统;建立生物信息数据质量的评估与检测系统;生物信息的在线服务;生物信息可视化和专家系统。 2. 基因组序列信息的提取 阅读全文
posted @ 2017-06-25 20:27 number_5 阅读(425) 评论(0) 推荐(0) 编辑