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课程链接: Machine Learning – Coursera 参考链接: shogun scikit-learn mlpy - Machine Learning Python FANN - Fast Artificial Neural Network Library Weka 3: Data 阅读全文
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1.脚本 This directory includes some useful codes: 1. subset selection tools. (子集抽取工具) subset.py 2. parameter selection tools. (参数选优工具) grid.py 3. LIBSVM 阅读全文
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Python基础到进阶合辑,你想要的Python知识都在这里--Python最全的文章、课程大合集,助你Python从初级到进阶,参与Python操作数据库、开发爬虫等实战,环环相扣,步步为营,你想要的Python的最全知识库全在这里! 1.【Python入门】:O课程-Python入门 2.【Py 阅读全文
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Libsvm is a simple, easy-to-use, and efficient software for SVM classification and regression. (可用于分类和回归) It solves C-SVM classification, nu-SVM class 阅读全文
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SVMs are considered by many to be the most powerful 'black box' learning algorithm, and by posing构建 a cleverly-chosen optimization objective优化目标, one 阅读全文
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In Week 6, you will be learning about systematically improving your learning algorithm. The videos for this week will teach you how to tell when a lea 阅读全文
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The Neural Network is one of the most powerful learning algorithms (when a linear classifier doesn't work, this is what I usually turn to), and this w 阅读全文
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Neural networks is a model inspired by how the brain works. It is widely used today in many applications: when your phone interprets(解释口译) and underst 阅读全文
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Logistic regression is a method for classifying data into discrete outcomes. For example, we might use logistic regression to classify an email as spa 阅读全文
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Octave/Matlab Tutorial Octave/Matlab Tutorial Basic Operations 你现在已经掌握不少机器学习知识了 在这段视频中 我将教你一种编程语言 Octave语言 你能够用它来非常迅速地 实现这门课中我们已经学过 或者将要学的 机器学习算法 过去我一 阅读全文
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SVM软件包 LIBSVM -- A Library for Support Vector Machines(本项目所用到的SVM包)(目前最新版:libsvm-3.21,2016年7月8日) C-SVC(C-support vector classification), nu-SVC(nu-sup 阅读全文
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项目实战 项目一:使用二代测序数据进行基因组组装(局部组装) 项目二:使用机器学习(SVM)进行基因预测 libsvm-3.21使用文档 Libsvm:脚本(easy.py、grid.py、subset.py、checkdata.py) | MATLAB/OCTAVE interface | Pyt 阅读全文
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官方网站: Weka 3: Data Mining Software in Java 相关使用方法博客 WEKA使用教程(经典教程转载) (实例数据:bank-data.csv) Weka初步一、二、三、四 使用Weka进行数据挖掘 一个小时速度入门数据挖掘WEKA(一个完整的小例子) 百度文库 W 阅读全文
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Machine Learning – Coursera Octave for Microsoft Windows GNU Octave官网 GNU Octave帮助文档 (有900页的pdf版本) Octave 4.0.0 安装 win7(文库) Octave学习笔记(文库) octave入门(文库 阅读全文
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课前问题: 思考我们日常生活中的ML是如何运作的,如Google page ranking、苹果相册里如何识别出人脸、邮件里的垃圾邮件识别、NLP、推荐系统 原理层面上,ML与传统编程的最大区别是什么?学习的哲学意义是什么?data/knowledge、train/punish、model/pred 阅读全文
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总结: 第9学时 其他函数和运算符 一件事情可以使用多种方法完成。 有哪些其他的函数和运算符? index()、rindex()、substr()、tr///、printf()、堆栈:push()、pop()、shift()、unshift()。splice()。 本节主要内容: 如何在一个标量中搜 阅读全文
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基因组组装 (四倍体陆地棉基因组 - 南农&诺禾 – Illumina2000 – PE100 – 245X - SOAPdenovo组装 – 17w BAC - 遗传图谱)Sequencing of allotetraploid cotton (Gossypium hirsutum L. acc. 阅读全文
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perl语言的核心是正则表达式,在文本处理上非常有优势,与python类似,但语法不同,perl的语法很灵活,用多了才会觉得好用。 常用知识点总结: perl语法类似于C语言(perl源于Unix),语句由逗号划分,代码层次使用花括号{}划分,但是不必声明变量类型; 标量变量($name),数组(@ 阅读全文
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SOAPdenovo是一个新颖的适用于组装短reads的方法,能组装出类似人类基因组大小的de novo草图。 该软件特地设计用来组装Illumina GA short reads,新的版本减少了在图创建时的内存消耗,解决了contig组装时的重复区域的问题,增加了scaffold组装时的覆盖度和长 阅读全文
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Long-read sequence assembly of the gorilla genome http://science.sciencemag.org/content/352/6281/aae0344 Insights into hominid evolution from the gori 阅读全文