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做生物的想发文章怎么办?转录调控来解析(huyou)! 最简单的情形: 1. 我在研究一个非常重要的基因A,功能已经做得差不多了,现在想深挖,第一步就是想知道哪个转录因子调控这个基因A; 2. 我发现了一个新颖的转录因子B,非常想知道这个TF到底在调控哪个基因。 研究方法不过几种: 1. RNA-s 阅读全文
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管家基因就是在细胞里稳定表达的基因,及时在胁迫状态下,表达的差异也不大。 以前做实验的时候就经常听说管家基因,因为在做RT-PCR的时候需要同时检测管家基因,这样可以用于矫正我们不同批次的结果。 List of housekeeping genes Human housekeeping genes, 阅读全文
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美国的第一个脑计划:The “Decade of the Brain” (1990-1999), an initiative involving the U.S. Library of Congress and the National Institutes of Health to enhance 阅读全文
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本文已投稿“脑人言”微信公众号,欢迎关注官方公众号,普及更多脑科学知识。 人脑,重约1400克,也许是我们世界里最复杂最精密的机器。它在功能上极具多样性,几乎承载了我们所有的智能活动(注意、学习、记忆、沟通和决策等);但它的核心结构却比较单一,一个由神经突触联结而成的神经元网络,其中包含了百亿级神经 阅读全文
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RLE Plots: Visualising Unwanted Variation in High Dimensional Data 参考:RLE Plots: Visualising Unwanted Variation in High Dimensional Data 阅读全文
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We estimate the maximum prediction accuracy for the risk of Alzheimer's disease based on disease prevalence and heritability of liability. We demonstr 阅读全文
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参考:Pearson Residuals 这些概念到底是写什么?怎么产生的? 统计学功力太弱了! 阅读全文
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统计学习方法里的一章。 参考: 如何用简单易懂的例子解释条件随机场(CRF)模型?它和HMM有什么区别? 阅读全文
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参考: Machine Learning Identifies Stemness Features Associated with Oncogenic Dedifferentiation 前所未有!10篇《Cell》文章及封面聚焦人类伟大成就:癌症基因组图谱TCGA!改写教科书式突破! “癌症大地图 阅读全文
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问题: DL的难点 目前机器学习和深度学习能做些什么?不能做什么? 机器学习的基本框架,分类 深度学习的基本框架,分类 如何最快的将深度学习应用到生物信息学、药物发现上? 为什么我应该学习深度学习? 深度学习开发框架的选择,用Google的还是Facebook的? 为什么深度学习必须要用GPU,和C 阅读全文
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参考: https://blog.csdn.net/xianlingmao/article/details/7340099 wiki 理解了贝叶斯之后,再理解这些概念就轻松很多,原文如下。 在贝叶斯统计中,如果后验分布与先验分布属于同类,则先验分布与后验分布被称为共轭分布,而先验分布被称为似然函数的 阅读全文
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神奇的伽玛函数(上) - 火光摇曳 看一个NB GLM模型,死活看不懂里面的一个符号,后来发现是伽马函数,二项分布函数居然能写成伽马函数形式,看了上文才发现伽马函数是阶乘在实数域的推广,俺确实是感受到了数学之美。 顺便wiki了一下欧拉,确实被此人震撼了,上天选中的天才。看完之后使命感爆棚,不想再做 阅读全文
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Univariate Distribution Relationships APPL: A Probability Programming Language Maplesoft - Software for Mathematics, Online Learning, Engineering 也有国内 阅读全文
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《breakthroughs in statistics》- 这本书理解透了,统计方面应该可以封神了。 亚马逊上有卖,貌似还有好几卷。 Breakthroughs in Statistics: Vol 3 (Springer Series in Statistics) 阅读全文
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网上说《线性代数应该这样学》非常不错,再配合大学教材,把线性代数的基本知识点过一遍。 线性代数 - 知乎 最近在跟一个教程:李宏毅的线性代数 基本知识: Rn :We denote the set of all vectors with n entries by Rn . We use Mmxn t 阅读全文
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HOG特征 HOG特征是特别适合于做图像中的人体检测的。看一看原版英文论文:Histograms of Oriented Gradients for Human Detection (引用数2w)YouTube上有作者自己的讲解 参见:目标检测的图像特征提取之(一)HOG特征 阅读全文
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参考: L1 Norm Regularization and Sparsity Explained for Dummies 专为小白解释的文章,文笔十分之幽默 减少feature的数量可以防止over fitting,尤其是在特征比样本数多得多的情况下。 L1就二维而言是一个四边形(L1 norm 阅读全文
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比对 The raw Drop-seq data was processed with the standard pipeline (Drop-seq tools version 1.12 from McCarroll laboratory). Reads were aligned to the E 阅读全文
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背景:We developed a cell-cycle scoring approach that uses expression data to compute an index for every cell that scores the cell according to its expre 阅读全文