Life·Intelligence

2020年7月25日

摘要：由数组成的集合叫做数集.常见的数集有:实数集R,有理数集Q,整数集Z,正整数(或自然数)集N,复数集C。正整数指的是1，2，3，4，5……那类的数自然数包括0和正整数。整数包括负整数，0，正整数。整数就是指…… -3 -2 -1 0 1 2 3 ……那类的数。不是自然数的整数是负整数，指-1 阅读全文

posted @ 2020-07-25 22:40 Life·Intelligence 阅读(41256) 评论(0) 推荐(1)

撰写复杂数学公式 | LaTeX排版入门

摘要： TOC LaTeX是什么？为什么要用LaTeX？ LaTeX的基本语法如何高效利用LaTeX？博客园里使用LaTeX 关于公式符号训练开始学习门槛可能会有点高，可是一旦学会将会收益无穷结合LaTeX语法，可以猜出某些符号的意义，反复区分，明确每个符号独一无二的意义，直到自己能够用无比严谨的数阅读全文

posted @ 2020-07-25 06:47 Life·Intelligence 阅读(1892) 评论(0) 推荐(0)

数学公式看不懂怎么办？| 基础统计学公式汇总

摘要：直觉思维和公式推导是两种截然不同的思维方式，想走快必须有直觉，想走远必须能推理。数学公式推导如何入门？为什么这么执着于数学统计？数学和统计是对世界及其产生数据最简洁、最优美、最本质的描述，我研究的切入点就是计算与其他生物学科的交叉，计算又怎么能离开数学和统计？必须让自己以数学和统计的思维去看待这阅读全文

posted @ 2020-07-25 01:01 Life·Intelligence 阅读(3345) 评论(0) 推荐(0)

2020年7月24日

惯性系 | 非惯性系 | 物理

摘要：在经典物理学与狭义相对论中，惯性参考系（常简称为惯性系）是指可以均匀且各向同性地描述空间，并且可以均匀描述时间的参考系。在惯性参考系内，系统内部的物理规律与系统外的因素无关。牛顿三大定律只对惯性系成立！所有与惯性参考系没有相对加速度（即相对静止或匀速直线运动）的参考系还是惯性参考系。通过以上的例阅读全文

posted @ 2020-07-24 23:52 Life·Intelligence 阅读(1965) 评论(0) 推荐(0)

Meta-analysis of GWAS | 原理 | 实例

摘要： TOC Meta-analysis是什么？常用的工具有哪些？深入Meta-analysis的统计学原理 Meta-analysis实例，输入输出分别是什么？ Meta-analysis注意事项，模型选择关于Meta的在不同场景下的意思 Meta-analysis是什么？常用的工具有哪些？就是整阅读全文

posted @ 2020-07-24 02:28 Life·Intelligence 阅读(5502) 评论(0) 推荐(0)

2020年7月23日

时间线 | timeline | 简易GitHub部署

摘要：一直都有个想法，想把有关自己的所有信息都按时间和地理位置排序，并加以组织，方便自己查询和遍历，提升自己对信息的把控能力。主要原因是我们都以天为单位活着，每天都有一个短期的工作记忆，短期记忆会被不断刷新，以至于过了一段时间后，失去线索后我们就彻底丢失了它们。如果能把这个做成一个成熟的产品，那我们个阅读全文

posted @ 2020-07-23 17:00 Life·Intelligence 阅读(1534) 评论(0) 推荐(0)

2020年7月22日

名词解释 | Lead SNPs | credible SNPs | Polygenicity | Discoverability

摘要： GWAS catalog里面的snp可以称作reported SNP lead SNPs 就是曼哈顿图里每根柱子最顶上的那个SNP 考虑LD的话，就是从每个loci 里面，选出P最小的点 Lead SNPs做了fine mapping后就得到了causal SNPs，即credible SNPs。阅读全文

posted @ 2020-07-22 03:23 Life·Intelligence 阅读(3286) 评论(0) 推荐(0)

Phenome-wide association studies | PheWAS

摘要： TOC 什么是Phenome-wide association studies？产生背景 PheWAS的基本原理，应用场景 PheWAS与GWAS的区别和联系 PheWAS实例什么是Phenome-wide association studies？产生背景 More recently, pheno 阅读全文

posted @ 2020-07-22 02:44 Life·Intelligence 阅读(2608) 评论(0) 推荐(0)

2020年7月21日

孟德尔随机化 | Mendelian randomization

摘要： TOC 什么是Mendelian randomization？研究背景？名称的由来？设计的初衷是什么？ Mendelian randomization的基本原理？ Mendelian randomization的应用场景？实例分析什么是Mendelian randomization？研究背景？名称阅读全文

posted @ 2020-07-21 22:18 Life·Intelligence 阅读(7495) 评论(0) 推荐(1)

探索性因子分析法 | exploratory factor analysis | EFA | Genomic Structural Equation Modelling | SEM

摘要：先别问那么多为什么，学就对了，到最后你自然能融会贯通，读书百遍其义自见。 TOC 什么是EFA，这个统计方法是用来解决哪一大类问题的？ EFA的大致原理？ EFA与CFA和PCA的区别？如何理解以下的遗传学中的EFA的使用？什么是EFA，这个统计方法是用来解决哪一大类问题的？属于因子分析（fa 阅读全文

posted @ 2020-07-21 19:04 Life·Intelligence 阅读(3780) 评论(0) 推荐(0)

2020年7月16日

摘要： “the only interesting thing about vertebrates is the neural crest” (Thorogood 1989) 前篇：名词解释 | Hedgehog signaling pathway | Hh | 刺猬学习发育生物学得有非常好的空间想象力，阅读全文

posted @ 2020-07-16 18:29 Life·Intelligence 阅读(605) 评论(0) 推荐(0)

名词解释 | Cryo-EM | Cryogenic electron microscopy | 冷冻电镜

摘要：教材定位：可以看Getting started in cryo-EM这门课程，电子教材：Electron Microscopy 待续~ 参考： 2017，诺贝尔奖，THE DEVELOPMENT OF CRYO-ELECTRON MICROSCOPY 施一公博士 Nieng Yan 颜宁 Cryo 阅读全文

posted @ 2020-07-16 14:24 Life·Intelligence 阅读(812) 评论(0) 推荐(0)

2020年7月15日

名词解释 | Hedgehog signaling pathway | Hh | 刺猬

摘要：这部分知识确实枯燥且繁杂，大学里的填鸭式学习注定是学不深的，大学阶段最重要的是搞明白框架，知道有这么个东西；然后做研究时带着问题去思考，查阅知识点，追踪追问式的学习，现在发现这部分其实还挺有趣的，产出的诺奖也比较多。教材定位：细胞生物学 - 细胞信号转导 - 其他细胞表面受体介导的信号通路知识阅读全文

posted @ 2020-07-15 19:50 Life·Intelligence 阅读(1723) 评论(0) 推荐(0)

生物信息学值得追踪的国际大会

摘要：主要目的是打开自己的视野，看看其他大佬都在做些什么，是否能帮助到我的研究主线。线下 American Society of Human Genetics European Society of Human Genetics Wellcome Trust Case Control Consortiu 阅读全文

posted @ 2020-07-15 11:51 Life·Intelligence 阅读(317) 评论(0) 推荐(0)

2020年7月12日

名词解释 | G-protein | G蛋白

摘要： 2020年07月12日，从今天开始整理所读的文献里面的每一个重点名词，争取半年后阅读所有生物学paper无压力。教材定位：《细胞生物学》 - 细胞信号转导 - G蛋白偶联受体介导的信号转导混淆概念：GFP，GTP，GDP 相关诺奖： 1971，发现并阐述cAMP的功能并提出第二信使学说； 199 阅读全文

posted @ 2020-07-12 21:58 Life·Intelligence 阅读(3265) 评论(0) 推荐(0)

2020年7月8日

（转）精准医学临床试验之“伞式研究“和“篮式研究”

摘要：总结：篮子实验就是把携带相同mutation的不同癌症放在一起，找到特定的drug，看一个drug是否对多种cancer的治疗有效。伞式研究就是把携带不同mutation的相同癌症放在其，分型，找特定药物的biomarker，以方便以后对症下药，但是这个工作量很大。 http://news.bi 阅读全文

posted @ 2020-07-08 22:26 Life·Intelligence 阅读(1234) 评论(0) 推荐(0)

2020年7月7日

（转）苏轼不可不读的十首词，人间万事，不过如此

摘要：林语堂说：提到苏轼，中国人总是亲切而温暖地会心一笑。苏轼一生屡遭贬谪，几十年都在被放逐的路上。可他却依旧泰然处之。把别人眼中的苟且，活成了自己的潇洒人生。这份豁达和修养，让我们这些后来人，不由得一赞三叹。 01 最超脱的一首词大江东去，浪淘尽，千古风流人物。故垒西边，人道是，三国周郎赤壁阅读全文

posted @ 2020-07-07 18:17 Life·Intelligence 阅读(412) 评论(0) 推荐(0)

2020年7月4日

RNA-seq建库技术 | RNA sequence library construction

摘要：为什么必须了解建库技术？转录组有哪些分类？有哪些常见的RNA-seq建库技术？各有什么特点活体真核细胞里有哪些RNA，各自有什么功能，占比多少？ PCR对RNA-seq的影响？PCR free是什么意思？为什么RNA-seq总有一部分reads无法比对到转录组？ RNA-seq有哪些常规分析阅读全文

posted @ 2020-07-04 18:38 Life·Intelligence 阅读(3939) 评论(0) 推荐(0)

2020年7月3日

读书笔记 - 清单革命 | GTD | 番茄工作法 | 四象限工作法

摘要：所长林超推荐为什么说清单是一种革命？读完这本书，你看这个结论是否正确。目录引言无知之错与无能之错第一部分清单革命是一场观念变革第一章人人都会犯错 - 心灵的转变第二章关键点比大而全更重要 - 系统要素的重塑第三章团队犯错的几率比单个人要小 - 智慧的差别第二部分清单革命的阅读全文

posted @ 2020-07-03 23:23 Life·Intelligence 阅读(1050) 评论(0) 推荐(0)

2020年6月6日

大脑信号数据处理 | AP | LFP | ECoG | EEG | fNIRS | fMRI

摘要：动作电位（Action potential, AP）：由单个神经元细胞膜的脉冲信号产生局部场电位（Local field potential, LFP）：代表电极的局部区域神经元电信号的总和皮质脑电（Electrocorticography, ECoG)：与局部场电位类似，但是只能记录皮层表面的阅读全文

posted @ 2020-06-06 10:19 Life·Intelligence 阅读(6429) 评论(0) 推荐(1)

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