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以Ezh2为例，彻底搞明白一个调控因子regulator的调控原理。 这个是一个非常典型的调控因子，广泛涉及了epigenome, regulatome and transcriptome，这里还会加入miRNA，一旦把这个搞清楚了将会受益无穷。 Polycomb-group proteins Po 阅读全文
posted @ 2020-10-06 00:49
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先说结论：除了哈勃红移，宇宙微波背景辐射直接让宇宙大爆炸理论从假设变成了公理。 核心图表：1975年，古老宇宙发射出的微波，对应一个温度为2.73K的黑体。 图表解读：2008，WMAP，球面图，温度差异2.73 ± 10-5K，可见这个分布非常均匀。宇宙诞生37.9万年发射出的第一批光子，换算回去 阅读全文
posted @ 2020-10-04 22:15
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开一个专门的标签，著名实验，主要科普一些非常solid的著名的实验，以这些实验为素材的思考将会非常可靠【不至于走偏太远】。 先说结论：哈勃红移是宇宙大爆炸和宇宙膨胀的直接证据，所有的行星都在离我们远去。 大爆炸理论最早也最直接的观测证据包括从星系红移观测到的哈勃膨胀、对宇宙微波背景辐射的精细测量、宇 阅读全文
posted @ 2020-10-03 23:43
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历史经验告诉我们，诺兰出品，必属精品。在TENET里，诺兰就开始解构时间这个目前最火热的概念。 因为这是好莱坞电影，所以吸睛的故事是必须的，但我对故事不感冒，我喜欢背后的科学哲学假设。 因为TENET有当代顶级的物理学家基普索恩做科学顾问，所以肯定不存在刘慈欣小说里的某些民科设定【爱的嘲讽】，可以大 阅读全文
posted @ 2020-10-03 22:19
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目录 什么是eQTL？是通过哪些数据计算得来的，数据格式是什么？ eQTL一般都富集在基因组的什么区域？ 几个常见的eQTL数据库 什么是GTEx？目前第几版了？GTEx里面有哪些数据？ GTEx有哪几篇里程碑文章？ 大部分课题组是如何利用GTEx数据的？ GTEx/eQTLGen数据下载downl 阅读全文
posted @ 2020-09-23 17:07
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收藏|基于表达谱研究疾病七大思路汇总 - 生信人 IF：9|全新的疾病特征基因筛选策略 - 生信人 昨天我们推广的疾病的分析思路，火爆网络，索性今天再来一个返场小段，供大家消遣一下。因为大部分的疾病不致死，或者说预后部分的信息收集并不全面，所以在做生信分析的时候跟肿瘤相比，就缺了最重要的一步预后效果 阅读全文
posted @ 2020-09-23 14:39
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优秀示例： https://yycunc.github.io/ https://github.com/lh3/lh3.github.com http://jekyllbootstrap.com/ 阅读全文
posted @ 2020-09-22 00:29
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关于什么是优秀的科研工作者，我们很难穷举，但是避开一些大坑是比较容易的。 科研工作的核心要义就是novel，即求新，任何重复性的工作都不算科研的核心内容【不是否认重复，重复是验证和强化的唯一手段】。 这就是为什么科研这么难又这么爽，一切都是创新，在人类的认知边缘探索。 目录： 过度在意成绩或课程作业 阅读全文
posted @ 2020-09-10 14:30
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最近我拜读了各位送交的年度工作计划，仔细推敲后，仍感到有三个方面的问题十分严重：第一，对课题理解不够，有的根本谈不上理解，做了不止一年，尚未进入角色。第二，已经完成的工作量严重偏少，博士（有的是从本室硕士上来的）做了几年还未见到可以发表的东西。第三，在计划中倾向于以最低工作量结束研究。即游击战法。以 阅读全文
posted @ 2020-09-01 22:03
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BioArt/解螺旋 这一类的公众号真的非常好，给读者整理了各种综述。 个人可以根据自己的需求Rank一下，重点阅读。 框架思维 为了圣杯，持之以恒。 看综述真滴爽，一直看一直爽。 bioart上我感兴趣的综述： 『珍藏版』Nature综述 | 基因表达调控的新模型 Pol I，合成大核糖体RNA（ 阅读全文
posted @ 2020-08-28 17:37
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- [A global overview of pleiotropy and genetic architecture in complex traits](https://www.nature.com/articles/s41588-019-0481-0)- Materials: /Users/z 阅读全文
posted @ 2020-08-25 11:08
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TOC 给自己的文章准备插图 怎样将位图转换为矢量图 - AI 小图变大图，增加清晰度 - 图像大小、分辨率 PS中非常常用的技巧 选区 路径 选择 - 色彩范围建立选区 弯度钢笔工具 - 绘制路径 - 填充路径 - 保存路径 写文章和做汇报PPT时，通常会用到卡通插图。 自己开始绘制插图的时候会非 阅读全文
posted @ 2020-08-16 00:17
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The pLI score reflects the tolerance of a given gene to the loss of function on the basis of the number of protein truncating variants, that is, the f 阅读全文
posted @ 2020-07-30 03:07
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搞GWAS和WGS必须要懂Association Test，就像搞genomics必须要懂比对alignment一样。 先从常识理解，Association关联，是一个比correlation还要宽泛的词，我们通常会说某个基因和某个疾病关联，即存在某种关系。 深入本质，在GWAS里的关联其实是hum 阅读全文
posted @ 2020-07-29 02:35
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模糊图片清晰化 http://waifu2x.udp.jp/ 还挺好用的，能放大2倍，处理后的图片更加平滑和锐化，没有任何失真。 最重要的是免费。 安全肯定是没有保障的，所以隐私图片不要拿它来处理。 去除纯色背景 http://www.aigei.com/bgremover/ 非常好用 简易韦恩图- 阅读全文
posted @ 2020-07-27 22:43
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2022年06月29日 HMS面试准备 27号晚上面试完了，非常成功，但却不一定能拿到offer。 成功点： 明确知道面试老板的需求，知己知彼百战百胜 之前的工作足够扎实，思考的够多，才能在不断的追问中defense住【老板平时怼得凶一点，你出去汇报才能少受点罪】 PPT做得足够好，能感受到你的诚意 阅读全文
posted @ 2020-07-27 02:45
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转自：GeenMedical Nature发表了一篇很好的文章，教科学家怎么在科学会议作报告。这篇文章很实用，特地分享一下。要点如下： 1. 了解你的听众。了解他们的知识水平，对你报告内容的了解程度及以前是否听过你的报告； 2. 在报告之前要想好报告的中心思想，把要传达的核心思想用一两句话写出来。把 阅读全文
posted @ 2020-07-27 00:39
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转自：机器学习研究组订阅号 如果你很着急、只是想要模板，可以直接跳到底部（但这样一点不酷），准备酷的人，迈出成为README大师的第一步吧！（绝对不是点击诱饵） 假如你刚刚创建了很棒的项目，并在GitHub上共享了它。你认为现在你只需坐等世界告诉你这个项目有多酷。毕竟，在过去的一个月中，你为这个极具 阅读全文
posted @ 2020-07-27 00:25
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国内教育 大家都是过来人，高考惨烈的应试教育，大学的混混生活，毕业后的就业之难，逃避就业的考研。 我生来平凡，没有特长，音乐、美术、体育都没有培养，也无缘奥赛班，高中分到市级最好高中的两个素质班之一，活在第一素质班的阴影之下。 一路走来，学习生活确实枯燥，听课-刷题-考试，称之为学习机器也不为过。 阅读全文
posted @ 2020-07-26 22:42
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http://www.qiushi.org/html/qiushihome/press/interviews/2014/0303/210.html 一个做生物的采访一个研究数学的。 天分 + 兴趣（自驱力）+ 好环境 + 持续努力 = 杰出（成功） 2013年底，基金会与北京国际数学研究中心的许晨阳 阅读全文
posted @ 2020-07-25 23:23
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