摘要：
SNPsnap已经可以被vsampler取代了 一个矛盾： GWAS得到的SNP做富集分析的话，通常都会有强的偏向性。 co-localization of GWAS signals to gene-dense and high linkage disequilibrium (LD) regions 阅读全文
posted @ 2019-11-19 19:46
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摘要：
这是一个进化学上的概念，基因组的序列是不断进化而来的，根据45个脊椎动物的基因组序列，通过多重比对，我们就可以知道人类基因组上每个位置的保守性，一些高度保守的区域可以做非常有意思的下游分析。 This directory contains compressed phastCons scores fo 阅读全文
posted @ 2019-11-19 15:51
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摘要：
2025年05月21日 很奇怪的gtf，属性排序不固定，而且有的行并没有基因名，写了个python脚本来提取。 import re import gzip import csv input_file = "genes.Homo_sapiens.GRCh38.109.gtf.gz" # 替换成你的文件 阅读全文
posted @ 2019-11-19 15:39
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