2018年3月28日
R最速文件读写 | 用R的dgCMatrix包来构建稀疏矩阵 | sparse matrix by dgCMatrix
摘要： 累了，写了一个多合一的读取函数，非常适合单细胞数据。 # quickly read large txt file to data.frame, matrix, or dgCMatrix fast.read.txt <- function(fileName, sep=",", format="data 阅读全文
posted @ 2018-03-28 17:16 Life·Intelligence 阅读(11611) 评论(0) 推荐(1) 编辑
GRCh38基因组和注释文件探究
摘要： ensembl/release91: 58302个ENSG id 56655个gene name（为什么有将近两千个是重复） 46种类型： GENCODE的注释gtf文件： ensembl 问题： 1. 为什么用gencode的注释文件做表达定量会出问题？ 2. 不同的release之间有什么区别？ 阅读全文
posted @ 2018-03-28 16:05 Life·Intelligence 阅读(6285) 评论(0) 推荐(0) 编辑
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