摘要：
参见： Question: How to extract all non-seqenced positions from a genome (Fasta file)? test.fa perl一行命令 转为规范化的bed 阅读全文
摘要：
What Ensembl genome version should I use for alignments? (e.g. toplevel.fa vs. primary_assembly.fa) 这是一个很细节也很实际的问题，到底用哪个版本？ 参考： What Ensembl genome ve 阅读全文
摘要：
常见的ORF预测工具 Open Reading Frame Finder - NCBI ORF Finder - SMS OrfPredictor - YSU 基本概念 开放阅读框（英语：Open reading frame；缩写：ORF；其他译名：开放阅读框架、开放读架等）是指在给定的阅读框架中， 阅读全文
摘要：
fai示例： http://www.htslib.org/doc/faidx.html offset比较让人费解，其实就是 bytes starting from zero，文件层次的属性，一般不需要关注。 有时需要将fasta转为bed，就是统计长度就好了，但是利用samtools faidx这个 阅读全文
摘要：
我们生信技能书有一篇介绍bedtools的文章，可以在微信里搜着看下，非常有用。 bedtools 用法大全 http://bedtools.readthedocs.io/en/latest/ gtf转bed用Linux命令完全可以实现，因为gtf每一行比较规律，不像fasta和fastq。 后面发 阅读全文