摘要: 之前的文章:构建NCBI本地BLAST数据库 (NR NT等) | blastx/diamond使用方法 | blast构建索引 | makeblastdb 本地运行blast时,需要指定out format。 常见的网页版blast结果可以参照:Blast结果的详细解析 默认是0,也就是会输出比对 阅读全文
posted @ 2018-03-19 16:53 Life·Intelligence 阅读(17004) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 工具推荐:https://github.com/openvax/gtfparse 真不敢相信,Linux自带的命令会这么强大,从gtf中提取出需要的transcript,看起来复杂,其实一个grep就搞定了。 本文出自于http://www.bioinfo-scrounger.com转载请注明出处 阅读全文
posted @ 2018-03-19 06:07 Life·Intelligence 阅读(5928) 评论(0) 推荐(0) 编辑
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