摘要: C/C++的速度是Python和perl所无法比拟的,尤其对于处理超大的生物信息学文件来说。 最近在写一个最简单的fastq cut工具,Python简直慢到不能忍,8G的fastq.gz文件的cut需要6-7个小时,而C++则只需要15-20min,简直就不在一个量级。 当然,听说Python有个cpython机制,可以加快速度,但和纯C++还是有差距的。 C++的编译比较复杂,这里只能做个... 阅读全文
posted @ 2017-07-27 15:15 Life·Intelligence 阅读(578) 评论(0) 推荐(0) 编辑
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